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使用因子覆蓋設計和等效分區的JMP®基因組學驗證

作者

Wenjun Bao，博士，SAS開發測試JMP經理
Joseph Morgan，JMP高級軟件開發人員，SAS joseph.morgan

JMP Genomics為科學家提供了一個複雜的統計軟件環境，用於分析基因組學和遺傳學研究中產生的大量數據集。JMP Genomics目前提供200多種分析程序（AP）。每個AP都由圖形用戶界面（GUI）訪問。這些AP提供了豐富的選項，可通過各種GUI控件訪問，使用戶可以輕鬆地根據可用數據定制分析。鑑於接口的複雜性和可用選項的組合性質，驗證這些程序可能是非常耗時的。例如，方差分析（ANOVA）AP由21個GUI控件組成，每個控件提供2到15個選項。徹底的測試需要大約170億個測試場景。如果我們假設每個場景需要五秒鐘來進行和評估測試，那麼完成一組測試需要大約2651年。因此不可能進行徹底的測試。幸運的是，因子覆蓋設計可用於顯著減少所需的測試場景數量，而不會對測試質量產生負面影響。事實上，這種用於驗證軟件的測試方案的方法幾乎與詳盡的測試一樣有效，但成本卻大大降低。因此，覆蓋設計和等效分區的因素在提高JMP基因組學驗證的效率和有效性方面發揮著核心作用。