Cosa ha ispirato questa richiesta nella lista dei desideri?
Attualmente, il modello 4PL (Four Parameter Logistic) integrato in JMP (JMP Pro 19.0.0) utilizza una funzione esponenziale con base e, mentre il nostro software di analisi biologica validato utilizza un modello 4PL con base b = 2. A causa di questa differenza, i risultati di JMP non possono essere confrontati direttamente con quelli generati dal nostro flusso di lavoro validato.
Il nostro team si affida a software validati per calcolare le potenze relative ed eseguire analisi di bioassay. Tuttavia, ogni azione eseguita dal software validato viene registrata in un registro di controllo, rendendo le analisi esplorative dispendiose in termini di tempo. Ad esempio, quando si valuta se la rimozione di uno specifico punto di diluizione dal bioassay migliori i criteri di idoneità come l'equivalenza, il parallelismo o l'R², ogni modifica richiede documentazione e giustificazione.
JMP è un ambiente eccellente per esplorare rapidamente i dati e comprendere come le modifiche influenzano le prestazioni del test. Tuttavia, l'impossibilità di definire un modello 4PL personalizzato utilizzando una base logaritmica diversa limita la nostra capacità di utilizzare JMP come strumento di screening ed esplorazione, pur mantenendo la coerenza con i nostri calcoli validati.
Quale miglioramento vorresti vedere?
Vorrei che JMP supportasse modelli 4PL definiti dall'utente, consentendo di specificare la base esponenziale/logaritmica utilizzata nell'equazione di adattamento della curva (ad esempio, base 2 invece dell'attuale implementazione in base e).
Inoltre, sarebbe utile se i modelli 4PL definiti dall'utente potessero sfruttare le stesse funzionalità di bioanalisi attualmente disponibili per i modelli predefiniti di JMP, tra cui:
- Calcoli della potenza relativa
- Test di parallelismo
- Test di equivalenza
- Stima dell'intervallo di confidenza
- Calcolo combinato della potenza relativa mediante test di omogeneità o eterogeneità
- Altri parametri di idoneità e comparabilità dei saggi biologici
Idealmente, gli utenti potrebbero definire una formula di modello personalizzata all'interno della piattaforma Bioassay o tramite un'interfaccia di scripting (JSL) e quindi applicare il flusso di lavoro standard di analisi bioassay a tale modello.
Esempio di utilizzo:
- Monta un modello 4PL personalizzato con base 2.
- Definire e valutare i criteri di idoneità del test.
- Rimuovere o includere i punti di diluizione selezionati.
- Osservare immediatamente l'impatto sulle stime di potenza relativa, sugli intervalli di confidenza, sull'equivalenza, sul parallelismo e sulle metriche di bontà dell'adattamento.
- Utilizzare i risultati per una valutazione esplorativa prima di eseguire l'analisi formale con un software validato.
Perché questa idea è importante?
Questa idea potrebbe migliorare significativamente il valore di JMP come strumento di esplorazione dei saggi biologici e di supporto alle decisioni.
Fornirebbe:
- Coerenza con i flussi di lavoro validati: gli utenti potevano riprodurre esattamente le specifiche del modello utilizzate nei software validati, aumentando la fiducia nel confronto dei risultati.
- Analisi esplorativa più rapida: gli scienziati potrebbero esaminare rapidamente i problemi di qualità dei dati, i valori anomali e gli scenari di adattamento alternativi senza l'onere associato ai sistemi validati.
- Maggiore efficienza: la valutazione dell'impatto delle modifiche ai dati su potenza relativa, intervalli di confidenza, equivalenza e parallelismo può essere effettuata in tempo reale.
- Maggiore flessibilità: le organizzazioni che utilizzano modelli di analisi personalizzati o predefiniti potrebbero utilizzare JMP senza dover compromettere le specifiche dei loro modelli consolidati.
- Adozione di JMP in ambienti regolamentati: JMP potrebbe fungere da potente ambiente di test per valutare il comportamento dei test prima dell'analisi e della rendicontazione formali.
Questa funzionalità dovrebbe essere implementata nella versione 20.
