高通量组学技术的快速发展催生了对集成化、用户友好型工具的需求，这些工具能够对复杂的生物数据进行稳健且可扩展的分析。在 JMP Pro 中，我们推出了 Genomics Studio，这是一个全新的插件，它围绕六大生物学领域——遗传学、RNA-seq、微生物组、单细胞、蛋白质组学和多组学——组织端到端的组学分析。每个领域都拥有其专属的引导式工作流程，这些工作流程基于该领域研究人员已使用的方法和术语构建而成。
每个工作流程并非采用僵化的线性流程，而是提供一系列建议的导入、预处理和分析步骤，用户可以根据自身数据和问题，以任意顺序执行全部或部分步骤。全局关键词搜索功能可直接按名称查找匹配的工具或平台，使经验丰富的用户无需进行菜单导航。Genomics Studio 主要基于 JMP 的原生统计引擎构建；对于 JMP 尚未提供的特定分析，该平台会调用 Python 作为补充支持，并可选择连接到 R 和 Bioconductor 以扩展功能——所有这些操作都无需用户切换工具或环境。
该平台目前支持六大领域的质量控制、缺失数据插补和标准化（包括用于组成微生物组数据的CLR标准化）；探索性和多元分析，例如PCA、PCoA、UMAP和Leiden聚类；以及推断性和建模方法，包括GWAS、预测建模、差异表达和丰度检测、富集分析、PERMANOVA、方差分量、标记基因识别以及通过CCA进行的多组学联合整合。每种方法都直接链接到其文档和引用，完成的分析可以导出为独立的HTML报告，无需任何插件或JMP许可证即可查看。
Genomics Studio 正在积极开发中，其覆盖领域也在不断扩展；由于任何步骤都可以调用 Python 脚本或 R 连接，因此无需更改架构即可添加新方法。Genomics Studio 将严谨的统计方法与引导式、可搜索的界面相结合，降低了高级组学分析的门槛，同时保持了分析深度——提供了一个统一的环境，减少了工作流程碎片化，并加速了生命科学领域的发现。
