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Importazione dei dati dai lettori di lastre: sfortunato formato n. 1: "scatole multiple"

Non sono sicuro di quale sia il nome più appropriato per il formato dei dati, ma mi riferisco a "scatole multiple".  In questo formato ogni lettura della piastra viene emessa in una griglia. o casella con l'etichetta riga e colonna, insieme al numero letto. Ogni casella è separata da una riga vuota.

C'è anche il presupposto che i dati grezzi inizino da A: 1, cioè in Excel sulla prima riga della tabella nella prima colonna della tabella.

 

L'obiettivo di formattazione dei dati è convertire questo formato nel numero minimo di colonne, dove c'è una variabile per colonna e un'osservazione per riga.  

Per utilizzare lo script allegato, vai in Excel e seleziona l'intera pagina e copialo (modifica, copia). Quindi accedi a JMP ed esegui lo script.

 

Lo script ha alcune parti interessanti, come rende una tabella dai dati salvati negli appunti.

Tutto il resto è solo una semplice formattazione e una logica per trasformare i dati in una forma utile.

 

 rev 2 note: la seconda versione dello script funziona meglio

 

 

Names Default To Here( 1 );
dt = New Table( "raw data" );
dt << Bring Window To Front;
Main Menu( "paste" );

dt1 = Current Data Table() << Stack(
 columns(
  :Column 2,
  :Column 3,
  :Column 4,
  :Column 5,
  :Column 6,
  :Column 7,
  :Column 8,
  :Column 9,
  :Column 10,
  :Column 11,
  :Column 12,
  :Column 13
 ),
 Source Label Column( "Label" ),
 Stacked Data Column( "Data" )
);

dt1 = Current Data Table();

dt1 << New Column( "temp1", formula( If( Length( :Column 1, ) > 1, :Column 1, Lag( :temp1, 1 ) ) ) );

dt1 << New Column( "temp2", formula( If( :Column 1 != Lag( :Column 1, 1 ), 1, Lag( :temp2, 1 ) + 1 ) ) );

dt1 << New Column( "temp3", formula( If( :Column 1 == "" | Contains( :Column 1, ":" ) > 0, 1, 0 ) ) );

dt1 << New Column( "Well ID", formula( :Column 1 || Char( :temp2 ) ) );

dt1 << run formulas();

dt1:temp2 << Delete Formula;
dt1:temp3 << Delete Formula;
dt1:temp1 << set name( "Plate ID" );
:name("Well ID") << Delete Formula;
:name("Plate ID") << Delete Formula;

dt1 << Select Where( is missing (:Data) == 1 | is missing(:Column 1)==1);
dt1 << delete rows;

dt1:Column1 << set name( "Row ID" );
dt1:temp2 << set name( "Column ID" );

:Data<<SET selected=""></SET>

 

La maggior parte degli strumenti esporterà i dati del lettore di piastre in un file Excel; tuttavia, il formato dei dati è generalmente difficile da formattare prima di iniziare l'analisi. Questo è un tentativo di gestire uno di questi formati