Il y a tellement de choses nouvelles à partager à propos de JMP Génomique 5 ! Au-delà de sa riche bibliothèque d’interfaces d’analyse et d’analyses prédéfinies pour les données génomiques, JMP Genomics offre à ses utilisateurs un accès complet à toutes les nouvelles fonctionnalités offertes par le JMP 9 Plate-forme. Je recommande vivement aux utilisateurs de JMP Genomics de se familiariser avec les nouvelles fonctionnalités de JMP 9. Site JMP et ici dans le blog JMP. Cette nouvelle version de JMP 9 est vraiment incroyable! Vous trouverez de nombreux outils qui vous aideront à explorer, filtrer et interagir avec vos ensembles de données génomiques.
Quand tu commences JMP Génomique 5 La première chose que vous remarquerez est l’élégance simple de la nouvelle interface utilisateur, qui tire pleinement parti du nouvel environnement de gestion Windows de JMP 9. Juste un mot d'avertissement: vous constaterez qu'il faut quelques minutes pour s'habituer à l'absence de la fenêtre principale trouvée dans les versions précédentes de JMP! Je suis un utilisateur JMP depuis la version 5, et je dois avouer que je l’ai trouvé un peu déroutant au début. Cependant, je suis sûr que, comme moi, vous allez vite comprendre à quel point il est maintenant facile de déplacer des fenêtres, en particulier si vous travaillez sur plusieurs moniteurs.

Dans l'une des fenêtres ouvertes, vous remarquerez les conseils du jour sur la génomique récemment mis à jour. Je vous encourage à jeter un oeil à travers ceux-ci. Je pense que même les utilisateurs expérimentés vont apprendre de nouvelles astuces sur JMP Genomics (et JMP) ici. Nous avons essayé d'inclure une série de conseils couvrant les questions fréquemment posées par les utilisateurs de JMP Genomics et des raccourcis JMP utiles. Soit dit en passant, si vous avez des idées de conseils à ajouter dans les versions futures, n'hésitez pas à Envoyez-nous un email nous le faire savoir.

Nous ouvrons également automatiquement notre nouveau JMP Genomics Starter, une fenêtre d’accueil personnalisable qui reflète l’organisation de notre menu Génomique. Vous pouvez laisser le démarreur ouvert en permanence sur votre bureau et l'utiliser pour naviguer parmi tous nos outils génomiques disponibles. Si vous souhaitez personnaliser votre vue de démarrage, cliquez simplement sur le bouton Personnaliser pour masquer des processus individuels ou des sections entières du menu. Une fois que vous avez créé un profil de démarrage que vous aimez, vous pouvez même l'exporter pour le partager avec d'autres utilisateurs. Cela permet aux administrateurs de simplifier plus facilement l'ensemble des choix proposés aux nouveaux utilisateurs de JMP Genomics ou de créer un ou plusieurs affichages Starter personnalisés pour les utilisateurs travaillant dans différents domaines fonctionnels.
Lorsque vous ouvrez le menu Génomique (ou examinez la fenêtre de démarrage), vous verrez une nouvelle section de menu appelée Mise en route. Dans cette section, vous trouverez le nouvel assistant JMP Genomics, un outil qui facilite plus que jamais la mise en route de nouveaux jeux de données. Cette interface interactive vous guide lors de la configuration de l'importation des exemples d'informations et du téléchargement de fichiers de bibliothèque ou d'annotation (si nécessaire). Il configure même automatiquement le processus d'importation approprié pour que vous puissiez importer des données à partir de plateformes de données génomiques ou de formats de texte courants.
Si vous exécutez un outil d'importation JMP Genomics ou affichez les résultats d'un processus d'analyse, vous verrez que les options graphiques et d'analyse de suivi sont désormais organisées en rapports à onglets. Les tableaux sous-jacents pour les graphiques présentés dans nos rapports à onglets sont maintenant masqués pour simplifier la présentation des résultats d'analyse complexes. Vous pouvez toujours rappeler facilement les tableaux masqués pour afficher les détails ou utiliser le menu déroulant d'un onglet pour ouvrir n'importe quel graphique dans une nouvelle fenêtre (par exemple, pour comparer des graphiques de différents onglets côte à côte). Vous pouvez également fermer tous les tableaux et graphiques à partir d'un seul bouton situé au bas du rapport à onglets.

Cette modification de l'interface utilisateur a été activée par de nouvelles fonctions de script dans JMP 9 et a été implémentée en réponse aux commentaires des utilisateurs. Nous avions entendu dire que les nombreux tableaux et graphiques multiples lancés à l'issue d'un processus JMP Genomics pouvaient parfois être accablants, en particulier pour les nouveaux utilisateurs. Compte tenu de ces commentaires, les rapports à onglets constituaient une priorité élevée dans la liste des tâches à effectuer lorsque nous avons déménagé. Génomique JMP développement sur JMP 9. Nous nous attendons à ce que les rapports à onglets soient une convention de sortie standard pour la plupart des processus de nos produits des sciences de la vie. En fait, l’équipe de développement travaille déjà sur une conversion similaire des résultats de sortie pour JMP Clinical en préparation d'une sortie de février sur le JMP 9 Plate-forme.