나의 막내 딸이 최근 재방송을 보았다. 주택 개선 Tim "The Tool Man"테일러와 그의 모의 TV 쇼 출연 공구 시간 . 그녀는 "아빠, 너와 팀 모두 전동 공구를 가지고 노는 동안 많은 어려움에 처해있는 것 같다"고 말했다. 아내는 통계에 차질을 던지면 문제가 증가한 것으로 보인다. 나의 격렬한 반대는 아래층의 화장실 개보수 프로젝트에서 땀을 흘린 구리 조인트와의 약간의 사고로 물 부족없이 올해 섣달 그믐 날을 어떻게 보냈는지를 포함하여 몇 가지 최근 사건을 상기 시켰습니다. 좋아요, 그래서 저는 DIY 마약 중독자이고 도구가 가득한 차고를 가지고 있습니다. 그러나이 경우 수술 단어는 경미합니다.
물론 가정용 프로젝트는 파워 드릴 없이는 아주 멀리까지 갈 수 없으며, 이중 배터리가 달린 18V 코드리스, 옛날 학교 3/8 "장인이 저주받은 배터리가 약해질 때마다 훌륭하게 작동하며, 빨간색 1/2 "밀워키는 사이드 핸들과 헤비 듀티 척으로 완성됩니다. 밀워키는 철도 동점에 구멍을 뚫고 큰 박격포를 혼합하는 것과 같은 사람의 물건에 적합합니다. Tim은 그것을 "Urghh Urghh"(그의 서명을 철자하는 나의 미약 한 시도 시미 안 / 원시인 / 스쿠비 - 마 / 츄바카 그 라트 )
이 블로그의 주제는 Drill Down입니다. 유전체학 데이터 세트는 일반적으로 수천에서 수백만 (경우에 따라 수십억)의 통계 테스트를 수행해야하며, 가장 중요한 통계를 가장 효과적으로 제시하고 탐색하는 방법에 즉시 직면하게됩니다. 드릴 다운의 기본 개념은 흥미로운 점을 강조 표시하는 요약 그래픽으로 시작하여 대화식으로 확대 / 축소하고 더 많은 통계 또는 그래픽 세부 정보를 계층 적으로 얻을 수있게하는 것입니다.
그러한 요약 그래프의 원형 예는 JMP Genomics의 One-Way ANOVA Analytical Process에 의해 생성 된 것과 같은 화산 플롯입니다.
각 점은 유전자를 나타냅니다. X 축은 변화의 척도 (예 : 최소 제곱 평균 간의 차이)를 차트로 나타내고 Y 축은 해당 -log10 p 값입니다. 이 플롯은 X와 Y의 통계적 관계 때문에 특징적인 V 자 모양을하고 있습니다. 가장 중요한 점은 상단을 향하고 있으며 화산에서 분출 한 용암 암석과 유사합니다 [여기에 Tim Taylor을 삽입하십시오] 그리고 가장 중요하지 않은 것들 - 광대 한 대다수 - 밑바닥이 멋지게 겉으로 드러난다. 플롯은 덤 드로 그램 및 평행 플롯과 같은 다른 디스플레이와 동적으로 링크되어 있으며 R에서 사용할 수없는 기능이 있습니다 (기록 참고 : Greg Gibson과 2001 년 Nature Genetics 지에서 "화산 플롯"이라는 용어를 사용했습니다. )
화산에서 원하는 지점을 선택한 후 다양한 "Drill Down"기능을 제공하는 "Action Buttons"창으로 이동하십시오 :
그런 작업 버튼으로 드릴 다운하는 것은 Google 어스를 확대 / 축소하는 것과 다릅니다. SAS 또는 JMP 기능을 최대한 활용하여 선택한 지점에 대한 정교한 통계 분석을 시작할 수 있습니다. 예를 들어, "선택한 행 및 플롯 LS 방법에 대한 데이터 입력에 맞는 모델"은 선택한 유전자에 대해 JMP의 적합 모델 플랫폼을 시작하고 (원래 지정한 동일한 모델을 사용하여) 통계 테이블과 그래픽의 정보 통합 통합을 생성합니다. "염색체 및 위치에 의한 OneWay 방법 플롯"을 클릭하면 SAS 데이터 스텝에서 단방향 모델을 구한 다음 다음과 같은 그래프를 생성합니다 :
이 경우 세 가지 치료 조건의 발현 프로파일이 게놈의 매우 짧은 부분에 따라 그려져 있습니다. 신뢰 밴드의 너비는 대화식으로 조정 가능하며 플롯은 초기 JMPG 대화 상자에 지정된 보조 파일에서 자동으로 통합 된 유전자 추적 주석으로 장식됩니다. 관심있는 유전자에 해당하는 다양한 웹 페이지를 더 자세히 살펴볼 수 있습니다.
그래서 Drury Down을위한 "Urghh Urghh"! JMP Genomics의 다른 몇 곳에서 이용 가능합니다 (예. 다차원 스케일링 및 예측 모델링) 향후 릴리스에서 더 많은 것을 기대할 수 있습니다.
그건 그렇고, 그 욕실 프로젝트는 이제 끝내 아름답게 밝혀졌습니다. 훈련 중 세 가지가 모두 도움이되었습니다 (밀워키를 빌리 시려면 알려주십시오). 완료까지 불과 4 개월이 걸렸으며 초기 하이 엔드 예상보다 3 배의 비용이 들었습니다. 더 중요하게, 대담 자들은 행복하게 침묵한다 (적어도 다음 주택 개량 프로젝트가 시작될 때까지) 
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