我最小的女兒最近正在看重播家居裝修以蒂姆“工具人”泰勒和他的模擬電視節目為特色工具時間 。她說：“爸爸，你和蒂姆在使用電動工具時似乎都遇到了很多麻煩。”我的妻子補充道，在混合物中投入統計學程度似乎增加了麻煩係數。我的強烈反對意見得到了回應，提醒我們最近發生的幾起事件，包括我們今年新年前夜的大部分時間沒有用水，因為我在樓下的浴室改造項目中出現了銅接頭的輕微不良事故。好吧，所以我是一個DIY迷，並且有一個裝滿工具的車庫，但在這個例子中的操作詞很輕微。
當然，如果沒有電鑽，沒有一個家庭項目會走得很遠，而且我有三個：一個18V無繩雙電池，一個老式的3/8“工匠，每當那些被詛咒的電池減弱時效果很好，紅色1/2 “密爾沃基配有側手柄和重型夾頭。密爾沃基雄偉壯觀，比如在鐵路領帶上鑽孔和混合大批量薄薄的砂漿。蒂姆會給它一個“Urghh Urghh”（我試圖拼寫他的簽名猿猴/穴居人/ Scooby-Do / Chewbacca咕嚕聲 ）
這將我們帶到這個博客的主題：深入研究。基因組學數據集通常需要進行數万至數百萬（有時甚至數十億）的統計檢驗，我們立即面臨如何最有效地呈現和探索最重要的數據。“向下鑽取”背後的想法是從一個概述圖形開始，該圖形突出顯示有趣的點，並使您能夠以交互方式放大它們並分層次地獲取更多統計或圖形細節。
這種摘要圖的典型示例是火山圖，例如由JMP Genomics的單向ANOVA分析過程生成的：
每個點代表一個基因。X軸繪製一些變化量度（例如，最小二乘平均值之間的差異），Y軸是相應的-log10 p值。由於X和Y之間的統計關係，該圖具有特徵V形。最重要的點是朝向頂部，類似於從火山噴出的熔岩岩石[插入Tim Taylor咕嚕咕嚕]和最不重要的 - 巨大的多數 - 在底部很好地過度。這些圖與動態鏈接到其他顯示，如樹狀圖和平行圖，完成刷牙和縮放，R中沒有這些功能。（歷史記錄：我相信格雷格吉布森和我在2001年自然遺傳學論文中創造了“火山圖”一詞。）
在火山中選擇所需的點後，轉到“動作按鈕”窗口，該窗口提供各種向下鑽取功能：
向下鑽取這樣的動作按鈕與縮放谷歌地球不同;您可以在所選點上啟動複雜的統計分析，充分利用SAS或JMP功能。例如，“為所選行和輸出LS平均輸入數據擬合模型”在所選基因（使用您最初指定的相同模型）上啟動JMP的擬合模型平台，並生成統計表和圖形的信息集成組合。單擊“通過染色體和位置繪製OneWay手段”可以在SAS數據步驟中擬合單向模型，然後生成如下圖形：
在這種情況下，沿著基因組的非常短的部分繪製三種處理條件的表達譜。置信帶的寬度可以交互式調整，並且該圖用基因軌跡註釋裝飾，該註釋自動地從初始JMPG對話框中指定的補充文件中合併。您可以進一步向下鑽取並顯示與感興趣的基因相對應的各種網頁。
所以“Urghh Urghh”鑽取！它可以在JMP Genomics的其他一些地方使用（例如 多維縮放和預測建模），您可以在將來的版本中獲得更多。
順便說一下，那個衛生間項目現在已經完成，結果很漂亮。所有三個演習都派上用場（如果你想藉用密爾沃基，請告訴我）。僅用了四個月就完成了，費用僅比我們最初的高端估算高出3倍。更重要的是，對話者高興地保持沉默（至少在下一個家庭裝修項目開始之前） 
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