JMP Genomics el líder del grupo de desarrollo Russ Wolfinger y Padraic Neville (SAS Analytics R&D) asistieron recientemente a la octava reunión cara a cara de la Consorcio de Control de Calidad MicroArray (MAQC) en la FDA en Rockville, MD. Los resultados de la primera fase de MAQC fueron publicados en la revista. Biotecnología de la naturaleza a finales de 2006 y se centró en la validación de plataformas de tecnología de microarrays.
El modelado predictivo es el foco de la segunda fase de MAQC (comúnmente llamado MAQC II), y gran parte del trabajo actual ha involucrado en la creación y prueba del modelado predictivo para varios conjuntos de datos diferentes. Este proyecto ha generado muchas actualizaciones para los procesos de modelado predictivo de JMP Genomics por Russ, Padraic, Pei-Yi Tan (también del grupo SAS Analytics) y otros desarrolladores del grupo JMP Genomics. Lo nuevo para la versión 3.2 son las curvas de aprendizaje y varias mejoras en la comparación de modelos de validación cruzada, que incluyen detalles para mostrar resultados de validación cruzada más detallados.
La conexión genómica entre científicos de la FDA. Centro Nacional de Investigaciones Toxicológicas (NCTR) y los equipos de desarrollo de Russ en SAS se remontan a varios años. Un proyecto para integrar JMP Genomics con la base de datos ArrayTrack desarrollado por el grupo de la Dra. Weida Tong en NCTR se ha completado bajo un Acuerdo de investigación y desarrollo cooperativo con NCTR . Como resultado del trabajo de integración, los científicos que utilizan ambos programas pueden mover datos de un lado a otro entre ArrayTrack y JMP Genomics, aprovechando las capacidades analíticas y de almacenamiento de datos de ambas plataformas. La Dra. Weida Tong es la Directora del Centro de Información sobre Toxicología de la FDA / NCTR, y su grupo, incluido el Dr. Leming Shi y otros, coordina muchos aspectos del proyecto MAQC.
