JMPゲノミクス開発グループのリーダーであるRuss WolfingerとPadraic Neville(SAS Analytics R&D)が最近、第8回対面会議に出席しました。マイクロアレイ品質管理(MAQC)コンソーシアムメリーランド州ロックビルのFDAで。MAQCの第一段階の結果がジャーナルに掲載されましたネイチャーバイオテクノロジー 2006年末にマイクロアレイ技術プラットフォームの検証に焦点を当てました。
予測モデリングは、MAQCの第2段階(一般にMAQC IIと呼ばれる)の焦点であり、現在の作業の多くは、いくつかの異なるデータセットに対する予測モデリングの作成とテストを含んでいます。このプロジェクトは、Russ、Padraic、Pei-Yi Tan(やはりSAS Analyticsグループからのもの)、およびJMP Genomicsグループからの他の開発者によるJMP Genomics予測モデリングプロセスに対する多くの更新を促しました。リリース3.2で新しく追加されたのは、学習曲線と、クロスバリデーションモデル比較のさまざまな機能強化です。これには、より詳細なクロスバリデーション結果を表示するためのドリルダウンが含まれます。
FDAの科学者間のゲノミクス関係国立毒性研究センター(NCTR) SASのラスの開発チームは数年前にさかのぼります。NCTRのWeida Tong博士のグループによって開発されたJMP GenomicsをArrayTrackデータベースと統合するプロジェクトは、 NCTRとの共同研究開発契約 。統合作業の結果、両方のプログラムを使用している科学者は、両方のプラットフォームの分析機能とデータストレージ機能を利用して、ArrayTrackとJMP Genomicsの間でデータを簡単にやり取りできます。Dr. Weida Tongは、FDA / NCTR毒性情報科学センターの所長であり、Leming Shi博士などを含む彼のグループは、MAQCプロジェクトの多くの側面を調整しています。