Genomica di JMP Il leader del gruppo di sviluppo Russ Wolfinger e Padraic Neville (SAS Analytics R & D) hanno partecipato di recente all'ottavo incontro faccia a faccia del Consorzio MicroArray Quality Control (MAQC) alla FDA di Rockville, MD. I risultati della prima fase di MAQC sono stati pubblicati sulla rivista Biotecnologia della natura verso la fine del 2006 e focalizzato sulla convalida delle piattaforme tecnologiche di microarray.
La modellizzazione predittiva è al centro della seconda fase di MAQC (comunemente chiamata MAQC II), e gran parte dell'attuale lavoro ha comportato la creazione e il test della modellazione predittiva per diversi set di dati. Questo progetto ha richiesto numerosi aggiornamenti ai processi di modellazione predittiva di JMP Genomics di Russ, Padraic, Pei-Yi Tan (anche del gruppo SAS Analytics) e altri sviluppatori del gruppo JMP Genomics. Novità per la versione 3.2 sono le curve di apprendimento e vari miglioramenti al confronto tra modelli di convalida incrociata, inclusi drill-down per visualizzare risultati di convalida incrociata più dettagliati.
La connessione genomica tra gli scienziati della FDA Centro nazionale per la ricerca tossicologica (NCTR) e i team di sviluppo Russ di SAS risalgono a diversi anni. Un progetto per integrare JMP Genomics con il database ArrayTrack sviluppato dal gruppo del Dr. Weida Tong presso NCTR è stato completato sotto un Accordo di ricerca e sviluppo in cooperazione con NCTR . Come risultato del lavoro di integrazione, gli scienziati che utilizzano entrambi i programmi possono facilmente spostare i dati avanti e indietro tra ArrayTrack e JMP Genomics, sfruttando le capacità di analisi e archiviazione dei dati di entrambe le piattaforme. Il Dr. Weida Tong è il direttore del centro FDA / NCTR per tossicodipendenti, e il suo gruppo, tra cui il dott. Leming Shi e altri, coordina molti aspetti del progetto MAQC.
