JMP Genomics Der Vorsitzende der Entwicklungsgruppe Russ Wolfinger und Padraic Neville (SAS Analytics R & D) nahm kürzlich am 8. Face-to-Face-Treffen der UBS teil MicroArray Quality Control (MAQC) -Konsortium bei der FDA in Rockville, MD. Die Ergebnisse der ersten Phase des MAQC wurden in der Zeitschrift veröffentlicht Nature Biotechnology Ende 2006 konzentrierte er sich auf die Validierung von Microarray-Technologieplattformen.
Vorhersagemodellierung ist der Schwerpunkt der zweiten Phase von MAQC (allgemein als MAQC II bezeichnet), und ein Großteil der aktuellen Arbeit bestand im Erstellen und Testen von Vorhersagemodellierung für mehrere verschiedene Datensätze. Dieses Projekt hat zahlreiche Aktualisierungen für JMP Genomics-Vorhersagemodellierungsprozesse von Russ, Padraic, Pei-Yi Tan (ebenfalls von der SAS Analytics-Gruppe) und anderen Entwicklern der JMP-Genomics-Gruppe hervorgerufen. Neu in Version 3.2 sind Lernkurven und verschiedene Verbesserungen beim Vergleich von Kreuzvalidierungsmodellen, einschließlich Drilldowns, um detailliertere Kreuzvalidierungsergebnisse anzuzeigen.
Die genomische Verbindung zwischen Wissenschaftlern der FDA Nationales Zentrum für toxikologische Forschung (NCTR) und Russ 'Entwicklungsteams bei SAS sind mehrere Jahre alt. Ein Projekt zur Integration von JMP Genomics mit der ArrayTrack-Datenbank, die von der Gruppe von Dr. Weida Tong am NCTR entwickelt wurde, wurde unter einem abgeschlossen Kooperatives Forschungs- und Entwicklungsabkommen mit NCTR . Als Ergebnis der Integrationsarbeit können Wissenschaftler, die beide Programme verwenden, Daten leicht zwischen ArrayTrack und JMP Genomics hin und her bewegen und dabei die Analyse- und Datenspeicherungsfunktionen beider Plattformen nutzen. Dr. Weida Tong ist Direktor des FDA / NCTR-Zentrums für Toxikoinformatik. Seine Gruppe, unter anderem Dr. Leming Shi und andere, koordiniert viele Aspekte des MAQC-Projekts.
