Génomique JMP Russ Wolfinger et Padraic Neville, responsable du groupe de développement, ont récemment assisté à la 8e réunion en face à face du Consortium de contrôle de la qualité MicroArray (MAQC) à la FDA à Rockville, MD. Les résultats de la première phase de MAQC ont été publiés dans la revue Nature Biotechnologie à la fin de 2006 et axé sur la validation des plates-formes technologiques de puces à ADN.
La modélisation prédictive est au centre de la deuxième phase de MAQC (communément appelée MAQC II), et une grande partie du travail actuel a consisté à créer et à tester une modélisation prédictive pour plusieurs ensembles de données différents. Ce projet a entraîné de nombreuses mises à jour des processus de modélisation prédictive JMP Genomics par Russ, Padraic, Pei-Yi Tan (également du groupe SAS Analytics) et par d'autres développeurs du groupe JMP Genomics. Les nouveautés de la version 3.2 sont les courbes d'apprentissage et diverses améliorations apportées à la comparaison de modèles à validation croisée, notamment des explorations permettant d'afficher des résultats plus détaillés de la validation croisée.
Le lien génomique entre les scientifiques de la FDA Centre national de recherche toxicologique (NCTR) et les équipes de développement de Russ chez SAS remontent à plusieurs années. Un projet visant à intégrer JMP Genomics à la base de données ArrayTrack développée par le groupe du Dr Weida Tong à NCTR a été achevé sous Accord de coopération en recherche et développement avec NCTR . Grâce au travail d'intégration, les scientifiques utilisant les deux programmes peuvent facilement transférer des données entre ArrayTrack et JMP Genomics, en tirant parti des capacités d'analyse et de stockage des données des deux plates-formes. Le Dr Weida Tong est le directeur du Centre de toxicologie informatique de la FDA / NCTR. Son groupe, dont le Dr Leming Shi et d’autres, coordonne de nombreux aspects du projet MAQC.
