零膨胀正连续计数数据的DSD分析工作流程嘿,
我收集了一些在DSD混杂因素框架下进行的计数数据。
我知道Fit DSD模块可能并不适用于这类数据。所以我想知道,考虑到二阶项中的混杂因素,模型选择的最佳工作流程是什么?
我已经用 ZI Gamma 和前向 AICc 测试了 GLM,但我还是忍不住考虑奇点对它的影响。
谢谢你!
高级统计建模实验设计回复:零膨胀正连续计数数据的DSD分析工作流程嗨@Tiago ,
欢迎加入社区!
如果没有更多背景信息或匿名数据集,可能很难帮到您,但以下几点或许对您有所帮助:
- 关于广义回归模型中要指定的分布,根据您的描述,我建议对于非负计数数据尝试零膨胀泊松分布。
如果您对要选择的分布类型有一些疑问,可以使用分布平台,通过拟合分布和测试拟合优度来检查哪种分布类型看起来最合适。
- 关于估计方法,我建议尝试以下两种选项:强制执行效应遗传选项(已选中) 的修剪前向选择和两阶段前向选择,因为这种估计方法的机制与适合 DSD平台所做的非常相似:
- 首先,构建主效应模型并估计这些效应,
- 其次,模型中考虑了高阶项(如交互作用和二次效应)。
希望这些初步意见对您有所帮助。
回复:零膨胀正连续计数数据的DSD分析工作流程感谢您及时且非常有用的回复, @Victor_G
我认为这确实解决了我的大部分核心问题。补充一点,我不能使用 ZI Poisson 分布,因为我对技术重复样本取平均值,所以数据不再是整数,即使它是计数数据。但我假设 Gamma 分布也同样适用,对吗?
再次感谢!
回复:零膨胀正连续计数数据的DSD分析工作流程嗨@Tiago ,
为了澄清一下,您指的是重复实验(在具有相同处理组合的单个实验中进行测量)还是多次重复(在同一实验中进行多次测量/计数)?
- 重复 重复测量是指在同一实验运行中(使用相同的样品,测量之间无需重置)进行多次响应测量。重复测量仅能减少测量系统误差(通过取重复测量的平均值)。由于重复测量是在同一实验单元上进行的,因此可以在数据表中手动添加新的列来记录重复测量。然后,您可以使用这些列来计算和建模平均测量值、方差等。
- 复制 重复实验是指针对每种处理组合进行多次独立的随机实验(每次实验之间进行重置并采集多个样本)。重复实验可以减少总实验变异(过程变异 + 测量变异),从而提供纯误差的估计值并降低预测误差(获得更精确的参数估计值)。由于每次实验都是独立的,因此在设计生成或扩充之后,重复实验数据会自动作为新行添加到数据表中。
第一种情况下,您可以使用具有合适分布的平均值(伽马分布可能适用于此设置,需在“分布”平台中验证)。第二种情况下,ZI-泊松分布可能更合适(仅限正整数)。
希望这样能解释清楚。
回复:零膨胀正连续计数数据的DSD分析工作流程嘿@Victor_G ,
您说得对。实验室里习惯把对同一样本的重复测量称为技术重复。很抱歉造成了误解,感谢您的澄清!