Flusso di lavoro di analisi DSD per dati di conteggio continuo positivi con inflazione di zeriEHI,
Dispongo di dati di conteggio che ho raccolto nell'ambito del confondimento DSD.
Mi rendo conto che il modulo Fit DSD probabilmente non è stato concepito per questo tipo di dati. Quindi mi chiedevo quale sarebbe il flusso di lavoro migliore per la selezione del modello, considerando la presenza di variabili confondenti nei termini di secondo ordine?
Ho testato il modello GLM con ZI Gamma e Forward AICc, ma non posso fare a meno di considerare l'effetto delle singolarità su questo.
Grazie!
Modellazione statistica avanzataProgettazione degli esperimentiOggetto: Flusso di lavoro di analisi DSD per dati di conteggio continuo positivi con inflazione di zeriCiao @Tiago ,
Benvenuto nella community!
Potrebbe essere difficile aiutarti senza maggiori informazioni o un set di dati anonimizzato, ma ecco alcune osservazioni che potrebbero esserti utili:
- Per quanto riguarda la distribuzione da specificare per i modelli di regressione generalizzata, in base alla tua descrizione consiglierei di provare una distribuzione di Poisson con inflazione di zeri per dati di conteggio non negativi.
Se hai dei dubbi sul tipo di distribuzione da scegliere, puoi verificare, tramite la piattaforma Distribuzioni, quale sembra la più appropriata adattando le distribuzioni e testando la bontà dell'adattamento .
- Per quanto riguarda il metodo di stima, consiglierei di provare queste due opzioni: Selezione in avanti con potatura e opzione di ereditarietà dell'effetto forzata (selezionata) e Selezione in avanti a due fasi , poiché il meccanismo di questo metodo di stima è molto simile a quello utilizzato dalla piattaforma Fit DSD :
- in primo luogo, costruisci un modello degli effetti principali e stima questi,
- In secondo luogo, nel modello vengono considerati i termini di ordine superiore (come l'interazione e gli effetti quadratici).
Spero che queste prime osservazioni possano esservi d'aiuto,
Oggetto: Flusso di lavoro di analisi DSD per dati di conteggio continuo positivi con inflazione di zeriGrazie per la risposta tempestiva e molto utile, @Victor_G
Penso che questo risolva effettivamente la maggior parte dei miei quesiti principali. Solo una piccola precisazione: non posso usare la distribuzione di Poisson di Ziehl-Neelsen perché calcolo la media di repliche tecniche, quindi non ho più numeri interi, anche se si tratta di dati di conteggio. Ma presumo che funzioni altrettanto bene con la distribuzione Gamma, giusto?
Grazie ancora!
Oggetto: Flusso di lavoro di analisi DSD per dati di conteggio continuo positivi con inflazione di zeriCiao @Tiago ,
Solo per chiarire, ti riferisci a repliche (misurazioni su singoli esperimenti con le stesse combinazioni di trattamento) o a ripetizioni (diverse misurazioni/conteggi sullo stesso esperimento)?
- Ripetizione Si tratta di effettuare misurazioni multiple della risposta sulla stessa sessione sperimentale (stesso campione, senza alcuna interruzione tra le misurazioni). Le ripetizioni riducono la variabilità del sistema di misurazione (utilizzando la media delle misurazioni ripetute). Le ripetizioni possono essere aggiunte manualmente in una tabella di dati come nuove colonne, poiché si ripete la misurazione sulla stessa unità sperimentale. È quindi possibile utilizzare queste colonne per calcolare e modellare la misurazione media, la varianza, ecc.
- Replicazione Si tratta di effettuare più esperimenti randomizzati indipendenti (campioni multipli con ripristino tra ogni esperimento) per ogni combinazione di trattamento. Le repliche riducono la variazione sperimentale totale (processo + misurazioni) al fine di fornire una stima dell'errore puro e ridurre l'errore di previsione (con stime dei parametri più accurate). Vengono aggiunte automaticamente (dopo la generazione o l'aumento del progetto) in una tabella di dati come nuove righe, in quanto rappresentano esperimenti indipendenti.
Nel primo caso, è possibile utilizzare la media con la distribuzione appropriata (la distribuzione Gamma potrebbe funzionare in questo contesto, da verificare con la piattaforma Distribuzioni). Nel secondo caso, la distribuzione ZI-Poisson potrebbe essere una distribuzione più appropriata (solo numeri interi positivi).
Spero che questo chiarisca la situazione,
Oggetto: Flusso di lavoro di analisi DSD per dati di conteggio continuo positivi con inflazione di zeriCiao @Victor_G ,
Hai ragione. È solo un'abitudine in laboratorio riferirsi alle misurazioni ripetute dello stesso campione come repliche tecniche. Mi scuso per l'ambiguità e grazie per il chiarimento!
