Flux de travail d'analyse DSD pour les données de comptage continues positives avec excès de zérosHé,
J'ai recueilli des données de comptage dans le cadre de la confusion DSD.
Je comprends que le module Fit DSD n'est probablement pas adapté à ce type de données. Je me demandais donc quelle serait la meilleure méthode de sélection du modèle, compte tenu des facteurs de confusion au sein des termes du second ordre ?
J'ai testé le GLM avec ZI Gamma et Forward AICc, mais je ne peux m'empêcher de prendre en compte l'effet des singularités sur ce modèle.
Merci!
Modélisation statistique avancéeConception des expériencesRe : Flux de travail d’analyse DSD pour les données de comptage continu positif avec excès de zérosSalut @Tiago ,
Bienvenue dans la communauté !
Il sera peut-être difficile de vous aider sans plus de contexte ou sans un ensemble de données anonymisées, mais voici quelques remarques qui pourraient vous être utiles :
- Concernant la distribution à spécifier pour les modèles de régression généralisée, d'après votre description, je recommanderais d'essayer une distribution de Poisson à excès de zéros pour les données de comptage non négatives.
Si vous avez des doutes sur le type de distribution à choisir, vous pouvez vérifier à l'aide de la plateforme Distributions celle qui semble la plus appropriée en ajustant des distributions et en testant la qualité de l'ajustement .
- Concernant la méthode d'estimation, je recommande d'essayer ces deux options : la sélection progressive élaguée avec l'option d'hérédité à effet activée (cochée) et la sélection progressive en deux étapes , car le mécanisme de cette méthode d'estimation est très similaire à celui de la plateforme Fit DSD :
- Premièrement, construisez un modèle à effets principaux et estimez ces derniers.
- deuxièmement, les termes d'ordre supérieur (comme les effets d'interaction et quadratiques) sont pris en compte dans le modèle.
J'espère que ces premières remarques vous seront utiles.
Re : Flux de travail d’analyse DSD pour les données de comptage continu positif avec excès de zérosMerci pour votre réponse rapide et très utile, @Victor_G
Je pense que cela répond effectivement à la plupart de mes questions principales. Petite précision : je ne peux pas utiliser la loi de Poisson de Ziegler-Zel'e, car je calcule la moyenne des réplicats techniques ; je n'ai donc plus d'entiers, même s'il s'agit de données de comptage. Mais je suppose que cela fonctionne tout aussi bien avec la loi Gamma, n'est-ce pas ?
Merci encore!
Re : Flux de travail d’analyse DSD pour les données de comptage continu positif avec excès de zérosSalut @Tiago ,
Pour être tout à fait clair, parlez-vous de réplicats (mesures effectuées sur des expériences individuelles avec les mêmes combinaisons de traitements) ou de répétitions (plusieurs mesures/comptages effectués sur la même expérience) ?
- Répétition Il s'agit d'effectuer plusieurs mesures de réponse sur une même série d'expériences (même échantillon, sans réinitialisation entre les mesures). Les répétitions permettent uniquement de réduire la variation due au système de mesure (en utilisant la moyenne des mesures répétées). Les répétitions peuvent être ajoutées manuellement dans un tableau de données sous forme de nouvelles colonnes, puisque la mesure est répétée sur la même unité expérimentale. Vous pouvez ensuite utiliser ces colonnes pour calculer et modéliser la mesure moyenne, la variance, etc.
- Réplication Il s'agit de réaliser plusieurs essais expérimentaux randomisés et indépendants (plusieurs échantillons avec réinitialisation entre chaque essai) pour chaque combinaison de traitements. Les réplications réduisent la variation expérimentale totale (processus + mesures) afin d'estimer l'erreur pure et de réduire l'erreur de prédiction (grâce à des estimations de paramètres plus précises). Elles sont ajoutées automatiquement (après la génération ou l'enrichissement du plan d'expérience) à un tableau de données sous forme de nouvelles lignes, puisqu'il s'agit d'essais expérimentaux indépendants.
Dans le premier cas, vous pouvez utiliser la moyenne avec la distribution appropriée (la distribution gamma peut convenir, à vérifier avec la plateforme Distributions). Dans le second cas, la distribution de Poisson-Zehnder (entiers positifs uniquement) peut être plus appropriée.
J'espère que cela clarifie la situation.
Re : Flux de travail d’analyse DSD pour les données de comptage continu positif avec excès de zérosSalut @Victor_G ,
Vous avez raison. C'est une habitude au laboratoire de désigner les mesures répétées d'un même échantillon par le terme de « réplicats techniques ». Veuillez m'excuser pour l'ambiguïté et merci pour ces précisions !
