Il nostro obiettivo a Genomica di JMP è sempre stato quello di rendere più facile per te, lo scienziato di genomica, analizzare e interpretare i tuoi dati. Il Guida dell'utente di JMP Genomics è stato lì per aiutarti a scegliere quale / i processo / i analitico meglio soddisfare le tue esigenze mostrandoti ciò di cui hai bisogno per eseguire ogni processo e, attraverso l'uso di un esempio illustrativo, come valutare e interpretare i tuoi risultati. Questa documentazione è cresciuta e si è evoluta con la crescita e l'evoluzione di JMP Genomics. Siamo orgogliosi di annunciare e mettere a disposizione dei nostri utenti la nuova edizione di Guida dell'utente di JMP Genomics .
Questo aggiornamento al Guida dell'utente di JMP Genomics combina ed estende le migliori caratteristiche del JMP originale Guida per l'utente di Genomics e il Manuale dell'utente di JMP Genomics - Supplemento che hai ricevuto con JMP Genomics. I capitoli esistenti sono stati rivisti e sono stati aggiunti nuovi capitoli. Tutti i capitoli sono stati completamente aggiornati con illustrazioni e spiegazioni dettagliate per la nostra versione attuale, JMP Genomics 3.2.
L'aggiornato Guida dell'utente di JMP Genomics è diviso tra i nove diversi volumi elencati di seguito:
- Introduzione a JMP Genomics . Questo manuale elenca le istruzioni e i requisiti di installazione, fornisce una breve introduzione a JMP Genomics e questa documentazione, nonché descrizioni dettagliate e istruzioni per l'impostazione e l'utilizzo dei flussi di lavoro di base di JMP Genomics. Questo manuale fornisce anche una guida alla risoluzione dei problemi, varie appendici, un glossario completo e un elenco completo di riferimenti per tutti i manuali.
Progettare esperimenti con JMP Genomics . Questo manuale descrive come usare le funzioni DOE di JMP per progettare il tuo esperimento e generare un file di progettazione sperimentale, che è il primo passo nella tua analisi.
Importazione e manipolazione dei dati con JMP Genomics . Questo manuale fornisce descrizioni dettagliate dei diversi tipi di set di dati usati da JMP Genomics, come importare dati da diverse fonti e come i set di dati risultanti possono essere manipolati e trasformati in formati appropriati per analisi specifiche.
Analisi del numero genetico e di copia . Questo manuale fornisce descrizioni dettagliate per la manipolazione di set di dati genetici, determinazione di statistiche specifiche sui marcatori, esecuzione di vari test di associazione, valutazione del collegamento, mappatura dei loci dei caratteri quantitativi, esecuzione di aplotipi e analisi del numero di copie.
Analisi di microarray . Questo manuale elenca e descrive una moltitudine di procedure per l'esecuzione del controllo di qualità sui dati, normalizzandoli, cercando modelli, adattando modelli statistici alle osservazioni e confrontando i risultati aggregati.
Modellazione predittiva . I tuoi dati possono essere utilizzati come base per fare previsioni su futuri esperimenti? Questo manuale descrive una serie di diversi modelli predittivi e le procedure per confrontare l'efficacia relativa dei diversi modelli con i dati.
Analisi delle annotazioni . Una volta identificato uno o più geni significativi, è necessario determinare il significato biologico di tali geni. Questo manuale fornisce informazioni su come utilizzare gli strumenti di JMP Genomics per incorporare il significato biologico con i risultati statistici.
Pre-elaborazione e analisi spettrale . Questo manuale descrive i processi di Genomics di JMP che sono utili per analizzare spettri bidimensionali e tridimensionali.
Guida alla programmazione . Questo manuale fornisce un'introduzione alla costruzione e alla programmazione dei propri processi analitici. I processi creati possono essere aggiunti al menu Genomics di JMP.
Per accedere a questa risorsa aggiornata, è sufficiente scaricare il file zippato dal sito Web JMP Genomics, decomprimerlo e copiarlo nella cartella della documentazione di JMP Genomics. Dopo averlo installato, puoi accedere a tutti e nove i volumi come in precedenza: basta selezionare Genomica> Documentazione e guida> Guida per l'utente per andare alla pagina di introduzione della Guida per l'utente. Da questo portale, fai clic sul link appropriato per accedere a un manuale specifico. Ogni manuale è dinamicamente referenziato a ciascuno degli altri manuali: basta seguire i collegamenti incorporati nei capitoli per accedere alle informazioni aggiuntive necessarie.
Gli utenti registrati di JMP Genomics devono guardare la posta in arrivo per un messaggio di posta elettronica contenente le istruzioni su come scaricare e installare l'ultimo aggiornamento alla Guida dell'utente di Genomics JMP.
