Unser Ziel bei JMP Genomics Es war immer ein Ziel, Ihnen als Genomik-Wissenschaftler die Analyse und Interpretation Ihrer Daten zu erleichtern. Das JMP Genomics Benutzerhandbuch war dabei, Ihnen bei der Auswahl des für Sie am besten geeigneten Analyseprozesses behilflich zu sein, indem er Ihnen zeigt, was Sie für die Ausführung jedes Prozesses benötigen, und anhand eines illustrativen Beispiels, wie Sie Ihre Ergebnisse bewerten und interpretieren. Diese Dokumentation ist gewachsen und weiterentwickelt worden, während JMP Genomics gewachsen und weiterentwickelt wurde. Wir sind stolz darauf, unseren Kunden die neueste Ausgabe der JMP Genomics Benutzerhandbuch .
Dieses Update zum JMP Genomics Benutzerhandbuch kombiniert und erweitert die besten Funktionen des ursprünglichen JMP Genomics-Benutzerhandbuch und das JMP Genomics Benutzerhandbuch - Ergänzung die Sie mit JMP Genomics erhalten haben. Bestehende Kapitel wurden überarbeitet und neue Kapitel hinzugefügt. Alle Kapitel wurden vollständig mit detaillierten Abbildungen und Erläuterungen zu unserer aktuellen Version, JMP Genomics 3.2, aktualisiert.
Die aktualisiert JMP Genomics Benutzerhandbuch ist auf neun verschiedene Bände aufgeteilt:
- Erste Schritte mit JMP Genomics . Dieses Handbuch enthält Installationsanweisungen und -anforderungen, eine kurze Einführung in JMP Genomics und diese Dokumentation sowie ausführliche Beschreibungen und Anweisungen zum Einrichten und Verwenden der grundlegenden JMP Genomics-Workflows. Dieses Handbuch enthält auch eine Anleitung zur Fehlerbehebung, verschiedene Anhänge, ein umfassendes Glossar und eine vollständige Referenzliste für alle Handbücher.
Experimentieren mit JMP-Genomics . In diesem Handbuch wird beschrieben, wie Sie die DOE-Funktionen von JMP verwenden, um Ihr Experiment zu entwerfen und eine experimentelle Designdatei zu generieren. Dies ist der erste Schritt Ihrer Analyse.
Datenimport und -bearbeitung mit JMP Genomics . Dieses Handbuch enthält detaillierte Beschreibungen der verschiedenen Arten von Datensätzen, die von JMP Genomics verwendet werden, wie Daten aus verschiedenen Quellen importiert werden und wie die resultierenden Datensätze bearbeitet und in für bestimmte Analysen geeignete Formate umgewandelt werden können.
Genetische und Kopienzahlanalyse . Dieses Handbuch enthält detaillierte Beschreibungen zur Manipulation genetischer Datensätze, zum Bestimmen spezifischer Markerstatistiken, zum Durchführen verschiedener Assoziationstests, zum Bewerten der Verknüpfung, zum Identifizieren quantitativer Merkmalsorte und zum Durchführen von Haplotyp- und Kopienzahlanalysen.
Microarray-Analyse . Dieses Handbuch listet und beschreibt eine Vielzahl von Verfahren, um die Qualitätskontrolle Ihrer Daten durchzuführen, zu normalisieren, nach Mustern zu suchen, statistische Modelle an die Beobachtungen anzupassen und die aggregierten Ergebnisse zu vergleichen.
Predictive Modeling . Können Ihre Daten als Grundlage für Vorhersagen zukünftiger Experimente verwendet werden? In diesem Handbuch werden verschiedene Vorhersagemodelle sowie Verfahren zum Vergleich der relativen Wirksamkeit der verschiedenen Modelle mit Ihren Daten beschrieben.
Anmerkungsanalyse . Nachdem Sie ein oder mehrere signifikante Gene identifiziert haben, müssen Sie die biologische Bedeutung dieser Gene bestimmen. In diesem Handbuch erfahren Sie, wie Sie mit JMP Genomics-Tools biologische Bedeutung in Ihre statistischen Ergebnisse integrieren.
Spektrale Vorverarbeitung und Analyse . Dieses Handbuch beschreibt die JMP-Genomics-Prozesse, die für die Analyse von zweidimensionalen und dreidimensionalen Spektren nützlich sind.
Programmieranleitung . Dieses Handbuch enthält eine Einführung in die Erstellung und Programmierung Ihrer eigenen Analyseprozesse. Von Ihnen erstellte Prozesse können dem JMP Genomics-Menü hinzugefügt werden.
Um auf diese aktualisierte Ressource zuzugreifen, laden Sie die gezippte Datei einfach von der JMP Genomics-Website herunter, entpacken Sie sie und kopieren Sie sie in Ihren JMP Genomics-Dokumentationsordner. Nach der Installation können Sie wie zuvor auf alle neun Volumes zugreifen: Wählen Sie einfach Genomics> Dokumentation und Hilfe> Benutzerhandbuch um auf die Einstiegsseite des Benutzerhandbuchs zu gelangen. Klicken Sie in diesem Portal einfach auf den entsprechenden Link, um zu einem bestimmten Handbuch zu gelangen. Jedes Handbuch ist mit den anderen Handbüchern dynamisch verlinkt. Folgen Sie einfach den in den Kapiteln eingebetteten Links, um auf die zusätzlichen Informationen zuzugreifen, die Sie benötigen.
Registrierte Benutzer von JMP Genomics sollten in ihren Posteingängen nach einer E-Mail mit Anweisungen zum Herunterladen und Installieren des neuesten Updates für das JMP Genomics-Benutzerhandbuch suchen.
