JMPコミュニティの皆様、こんにちは。
私は、各曲線が基本的に同じモチーフをX軸に沿って平行移動させたものであり、振幅や形状に本質的な変化がほとんどない合成データセットで、 Functional Data Explorerをテストしてきました。
このような状況では、結果として得られるFPCA/FPC基底はますます振動的になり、物理的な解釈が難しくなるという印象を受けます。言い換えれば、一つの単純な現象(同じモチーフの水平方向のずれ)が、コンパクトで直感的な低次元表現を生み出すのではなく、複数の成分に分散してしまうようです。
このことから、私がこの種のデータに対してFDEを間違った方法で使用しているのか、あるいは位相変動が支配的な場合にこれが既知の制限事項なのか、疑問に思いました。
私は特にHPLC/クロマトグラフィーデータに興味があり、ピークが保持時間内で移動する際にこのような状況がごく自然に発生する可能性があると考えています。
私の質問は以下のとおりです。
- JMP/FDEにおいて、主要な変動要因がX軸に沿ったシフトである場合、推奨されるベストプラクティスは何ですか?
- 曲線は最初に位置合わせ/登録すべきでしょうか? (for example with
Align Maximum) before running FPCA/FDE, when the shift is not the phenomenon of interest?
- 非パラメトリック/非ピークモデリングのワークフローを維持することが目的の場合、JMPではこのような位相変動を処理するための推奨されるアプローチはありますか?
- より一般的には、どのように判断しますか?
- シフトを機能的変動の一部として維持する、
- それとも、次元削減の前にアライメントによって先に削除するべきでしょうか?
特にクロマトグラフィーデータにおいて、明示的なピークモデリングを避けたい場合、他の方々が実際にどのように対処しているのか、ぜひお聞かせいただきたいです。
前もって感謝します!