Hallo JMP-Community,
Ich habe Funktionaler Daten-Explorer an einem synthetischen Datensatz getestet, bei dem jede Kurve im Wesentlichen dasselbe Motiv darstellt, das entlang der X-Achse verschoben ist, mit nur geringfügigen intrinsischen Änderungen in Amplitude oder Form.
In dieser Situation entsteht der Eindruck, dass die resultierende FPCA/FPC-Basis zunehmend oszillatorisch wird und die physikalische Interpretation erschwert wird. Anders ausgedrückt: Ein einfaches Phänomen (eine horizontale Verschiebung desselben Motivs) scheint sich über mehrere Komponenten zu verteilen, anstatt eine kompakte und intuitive niedrigdimensionale Darstellung zu liefern.
Dies hat mich zu der Frage geführt, ob ich FDE für diese Art von Daten auf die falsche Weise verwende, oder ob dies eine bekannte Einschränkung ist, wenn die Phasenvariation dominiert.
Mein besonderes Interesse gilt HPLC-/chromatographischen Daten , bei denen diese Situation ganz natürlich auftreten kann, wenn sich die Retentionszeiten der Peaks verschieben.
Meine Fragen lauten:
- Welche Vorgehensweise wird in JMP/FDE empfohlen, wenn die dominante Variabilität eine Verschiebung entlang der X-Achse ist?
- Sollten die Kurven zuerst ausgerichtet/registriert werden? (for example with
Align Maximum) before running FPCA/FDE, when the shift is not the phenomenon of interest?
- Wenn das Ziel darin besteht, in einem nichtparametrischen/nicht-peakmodellierenden Arbeitsablauf zu bleiben, gibt es in JMP eine bevorzugte Vorgehensweise für den Umgang mit dieser Art von Phasenvariation?
- Allgemeiner gefragt: Wie entscheiden Sie, ob Sie:
- Die Verschiebung als Teil der funktionalen Variation beibehalten.
- Oder sollte es zuerst durch Ausrichtung entfernt werden, bevor die Dimensionsreduktion erfolgt?
Ich wäre sehr daran interessiert zu erfahren, wie andere dies in der Praxis handhaben, insbesondere bei chromatographischen Daten, wenn man eine explizite Peakmodellierung vermeiden möchte.
Dank im Voraus!
