Notre objectif chez Génomique JMP Le chercheur en génomique a toujours eu la facilité d’analyser et d’interpréter vos données. le Guide de l'utilisateur JMP Genomics a été là pour vous aider à choisir le ou les processus analytiques qui répondent le mieux à vos besoins en vous indiquant ce dont vous avez besoin pour exécuter chaque processus et, à l'aide d'un exemple illustratif, comment évaluer et interpréter vos résultats. Cette documentation a grandi et évolué au fur et à mesure que JMP Genomics a grandi et évolué. Nous sommes fiers d’annoncer et de mettre à la disposition de nos utilisateurs la nouvelle édition du Guide de l'utilisateur JMP Genomics .
Cette mise à jour du Guide de l'utilisateur JMP Genomics combine et étend les meilleures fonctionnalités du JMP d'origine Guide de l'utilisateur en génomique et le Guide de l'utilisateur de JMP Genomics - Supplément que vous avez reçu avec JMP Genomics. Les chapitres existants ont été révisés et de nouveaux chapitres ont été ajoutés. Tous les chapitres ont été entièrement mis à jour avec des illustrations détaillées et des explications pour notre version actuelle, JMP Genomics 3.2.
La mise à jour Guide de l'utilisateur JMP Genomics est divisé entre les neuf volumes énumérés ci-dessous:
- Premiers pas avec JMP Genomics . Ce manuel répertorie les instructions d'installation et les conditions requises, fournit une brève introduction à JMP Genomics et à cette documentation, ainsi que des descriptions détaillées et des instructions pour la configuration et l'utilisation des processus de base de JMP Genomics. Ce manuel fournit également un guide de dépannage, diverses annexes, un glossaire complet et une liste de référence complète pour tous les manuels.
Conception d'expériences avec la génomique JMP . Ce manuel explique comment utiliser les fonctions DOE de JMP pour concevoir votre expérience et générer un fichier de conception expérimentale, première étape de votre analyse.
Importation et manipulation de données avec JMP Genomics . Ce manuel décrit en détail les différents types d’ensembles de données utilisés par JMP Genomics, explique comment importer des données de différentes sources et explique comment les ensembles de données résultants peuvent être manipulés et transformés en formats adaptés à des analyses spécifiques.
Analyse génétique et du nombre de copies . Ce manuel fournit des descriptions détaillées permettant de manipuler des ensembles de données génétiques, de déterminer des statistiques de marqueurs spécifiques, de réaliser divers tests d’association, d’évaluer les liaisons, de mapper des locus de traits quantitatifs et de réaliser des analyses d’haplotypes et de nombres de copies.
Analyse de puces à ADN . Ce manuel répertorie et décrit une multitude de procédures permettant de contrôler la qualité de vos données, de les normaliser, de rechercher des modèles, d’adapter des modèles statistiques aux observations et de comparer les résultats agrégés.
Modélisation prédictive . Vos données peuvent-elles servir de base à la prévision d’expériences futures? Ce manuel détaille un certain nombre de modèles prédictifs différents ainsi que des procédures permettant de comparer l'efficacité relative des différents modèles avec vos données.
Analyse d'annotation . Une fois que vous avez identifié un ou plusieurs gènes significatifs, vous devez déterminer la signification biologique de ces gènes. Ce manuel explique comment utiliser les outils JMP Genomics pour intégrer une signification biologique à vos résultats statistiques.
Prétraitement et analyse spectrale . Ce manuel décrit les processus JMP Genomics utiles pour l’analyse de spectres bidimensionnels et tridimensionnels.
Guide de programmation . Ce manuel fournit une introduction à la construction et à la programmation de vos propres processus analytiques. Les processus que vous créez peuvent être ajoutés au menu JMP Genomics.
Pour accéder à cette ressource mise à jour, il suffit de télécharger le fichier compressé à partir du site Web de JMP Genomics, de le décompresser et de le copier dans votre dossier de documentation JMP Genomics. Après l’avoir installé, vous pouvez accéder aux neuf volumes comme auparavant: il suffit de sélectionner Génomique> Documentation et Aide> Guide de l'utilisateur aller à la page d’entrée du Guide de l’utilisateur. Depuis ce portail, il suffit de cliquer sur le lien approprié pour accéder à un manuel spécifique. Chaque manuel est référencé dynamiquement avec chacun des autres manuels - il suffit de suivre les liens incorporés dans les chapitres pour accéder aux informations supplémentaires dont vous avez besoin.
Les utilisateurs enregistrés de JMP Genomics doivent consulter leur boîte de réception pour recevoir un courrier électronique contenant des instructions sur le téléchargement et l'installation de la dernière mise à jour du Guide de l'utilisateur de JMP Genomics.
