Bonjour à la communauté JMP,
J'ai testé Explorateur de données fonctionnelles sur un ensemble de données synthétiques où chaque courbe représente essentiellement le même motif translaté le long de l'axe X, avec peu de changement intrinsèque d'amplitude ou de forme.
Dans ce cas, j'ai l'impression que la base FPCA/FPC résultante devient de plus en plus oscillatoire, et son interprétation physique se complexifie. Autrement dit, un phénomène simple (un décalage horizontal d'un même motif) semble se répartir sur plusieurs composantes au lieu de donner lieu à une représentation compacte et intuitive de faible dimension.
Cela m'a amené à me demander si j'utilise la FDE de manière inappropriée pour ce type de données, ou s'il s'agit d'une limitation connue lorsque la variation de phase est prédominante.
Je m'intéresse particulièrement aux données HPLC/chromatographiques , où cette situation peut se produire tout naturellement lorsque les pics se déplacent dans le temps de rétention.
Mes questions sont :
- Quelle est la meilleure pratique recommandée dans JMP/FDE lorsque la variabilité dominante est un décalage le long de X ?
- Les courbes doivent-elles être alignées/enregistrées au préalable ? (for example with
Align Maximum) before running FPCA/FDE, when the shift is not the phenomenon of interest?
- Si l'objectif est de rester dans un flux de travail non paramétrique / sans modélisation de pics , existe-t-il une approche privilégiée dans JMP pour gérer ce type de variation de phase ?
- Plus généralement, comment décide-t-on s'il faut :
- conserver le décalage dans le cadre de la variation fonctionnelle,
- ou bien le supprimer d'abord par alignement avant la réduction de dimensionnalité ?
Je serais très intéressé de savoir comment les autres gèrent cela en pratique, notamment pour les données chromatographiques lorsqu'on souhaite éviter une modélisation explicite des pics.
Merci d'avance!
