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JMP 19.0.4 Windows > R 함수(일부는 더 이상 사용되지 않음)가 포함된 JMP 17 스크립트를 어떻게 변환하나요?

안녕,

JMP 17에서 만든 R 함수를 호출하는 간단한 스크립트 몇 개가 있습니다. JMP를 최신 버전(19.0.4)으로 업그레이드했더니 이 스크립트들이 더 이상 작동하지 않습니다. 파이썬 환경에서 R을 통합하는 방법에 대한 문서가 부족해서 도움을 주시면 정말 감사하겠습니다.

Names default to here (1);

dt = current data table ();

nw = New Window ("ENSEMBL_ID COLUMN SELECTION",
		<< Modal,
		Text Box ("Select the ENSEMBL_ID column"),
		lcol = Col List Box (Data Table (dt),
							All,
							width (500)
							),
		Button Box ("OK", scol = lcol << get selected; switch = 1),
			
		Button Box ("CANCEL", switch = 0; Throw(1)),					
							
		);


If (switch, 
	enbl_col_list = as column (scol) << get values ();
	r init();
	R send (enbl_col_list);
	R Submit(	"\[library(biomaRt)
					library("org.Hs.eg.db")
					library("AnnotationDbi")
					output <- mapIds(org.Hs.eg.db, keys = enbl_col_list, keytype = "ENSEMBL", column = "SYMBOL")
					output_df <- as.data.frame (output)
					print(output_df)
					]\");
	
	dt_out = r get (output_df);
	R Term (),
Throw (1));

감사합니다.

최상의,

TS

자동화 및 스크립팅제목: JMP 19.0.4 Windows > R 함수(일부는 더 이상 사용되지 않음)가 포함된 JMP 17 스크립트를 어떻게 변환하나요?

JMP 19에서 R을 사용하는 방법에 대한 훌륭한 소개 자료가 여기 있습니다.
스크립터스 클럽 녹화: JMP 19에서 R이 다시 돌아왔습니다 - R과 Python 통합 살펴보기

코드를 수정할 필요는 없을 것 같습니다.
R을 설치하고, R 명령어에서 사용되는 라이브러리를 R에서 설치하기만 하면 됩니다.

그런 다음 JSL 코드를 실행하면 JMP가 Python/ rpy2를 통해 R을 제어합니다.

제목: JMP 19.0.4 Windows > R 함수(일부는 더 이상 사용되지 않음)가 포함된 JMP 17 스크립트를 어떻게 변환하나요?

안녕 호기,

피드백 감사합니다. 이상하게도 제 시스템에서는 스크립트가 아무런 출력도 없이 충돌합니다.

R 설정을 확인해서 필요한 패키지가 제대로 설치되어 있는지 확인하겠습니다.

최상의,

TS

제목: JMP 19.0.4 Windows > R 함수(일부는 더 이상 사용되지 않음)가 포함된 JMP 17 스크립트를 어떻게 변환하나요?

안녕하세요, JMP 커뮤니티 여러분!

스크립트에서 문제를 발견했습니다. JMP 리스트를 문자열 벡터로 변환하는 R 명령어인 UNLIST(data)를 추가해야 메인 명령어가 제대로 작동했습니다.

최상의,

TS