No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Estoy intentando analizar un conjunto de datos que utiliza puntos de señal brutos (y, respuesta) y concentración (x, fórmula predictora) para un ensayo tipo ELISA mediante un modelo logístico 4P. Al aplicar una ponderación 1/y^2 a la columna de puntos de señal brutos, el gráfico deja de ajustarse, lo que da un R = ~0,45. Esta misma placa se ha analizado con otro software, así que me pregunto qué está pasando. Agradezco cualquier ayuda.
cálculo de ponderación: 
Modelado estadístico avanzadoAnálisis y modelado de datos básicosRe: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Es difícil discernir cuál es el problema sin datos, ¿podría proporcionarnos un ejemplo de lo que está discutiendo?
Gracias,
Ben
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Hola Ben,
¡Agradezco tu respuesta! A continuación se muestran los números con los que trabajo. Se trata de una serie de dilución simple que intento ajustar con la "columna de señal promedio 1 y 2" en el eje Y y la "Concentración teórica" en el eje X. La columna de ponderación se obtiene al usar la formulación anterior en la publicación original. Tras analizar con un modelo no lineal, el 4PL no encaja (sí encaja al eliminar la ponderación).
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Hola @CurseOfCheetah8 ,
El L4P parece estar funcionando como se esperaba con la ponderación, solo tiene dificultades porque los datos ponderados no se ajustan bien a un modelo de 4 parámetros, lo que se puede ver en la tabla de estimaciones de parámetros:
¿Podría ser que la ecuación de tu software sea diferente a la que usa JMP? De ser así, podrías intentar transferirla y usar la plataforma no lineal.
Avísame si hay diferencias y puedo enviarte más recursos para ayudar.
Gracias,
Ben
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)¿Es razonable modelar estos datos con cualquier 4PLC cuando la respuesta es esencialmente lineal al cambio en la concentración?
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Estoy de acuerdo en que el ajuste lineal funciona con la ponderación. Desafortunadamente, este es un ensayo prevalidado que especifica el uso de un 4PL con una ponderación de 1/y^2, por lo que mi análisis es limitado. Estoy intentando entender por qué un 4PL se vería tan diferente entre dos programas (MSD WorkBench y JMP). Gracias por tu ayuda; parece que el siguiente paso es intentar ver qué ecuación usa el otro programa.
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Hola @CurseOfCheetah8 : Mirando aquí podemos ver lo que está haciendo MSD WorkBench.
https://www.mesoscale.com/~/media/files/manuals/discovery%20workbench%20v4%20users%20guide.pdf?la=es
MSDW utiliza lo que se indica a continuación como "Farmacopea de los Estados Unidos: USP <1034>". JMP utiliza lo que se indica como "Farmacopea Europea".
https://www.quantics.co.uk/blog/¿Qué-es-la-formula-4pl/?
Por lo tanto, están parametrizados de manera diferente.
Dicho esto... para sus datos, abandonaría el modelo 4PL sin importar lo que diga su protocolo (es decir, los datos no siguen ni de cerca la forma sigmoidea del modelo 4PL).
Además, dices: "Esta misma placa se analizó con otro software, ¿correcto?". ¿A qué te refieres exactamente con "correcto"?
Editar: Buena discusión aquí también.
https://community.jmp.com/t5/Discussions/4PL-fit-4-parameter-logistic/td-p/15836
Re: No se puede ajustar una curva 4PL después de aplicar la ponderación (1/y^2)Hola @CurseOfCheetah8 ,
Intenté importar la fórmula de Meso a JMP (mira la columna de fórmulas aquí) y ejecutarla en la plataforma no lineal. Converge, aunque el resultado es deficiente en cuanto a ajuste. Revisa los valores estimados que tu otro software generó para cada parámetro: ¿son similares? Quizás necesites establecer rangos adecuados para cada parámetro para que NL converja correctamente.
Gracias,
Ben
