重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線を当てはめることができませんELISA型アッセイの生のシグナルポイント(y、レスポンス)と濃度(x、予測式)を用いたデータセットを、ロジスティック4Pモデルを用いて解析しようとしています。生のシグナルポイントの列に1/y^2の重み付けを適用すると、グラフが合わなくなり、R = ~0.45という結果になりました。同じプレートを別のソフトウェアで解析したのですが、一体何が起こっているのか分かりません。どなたかご助力いただけると幸いです。
重み付け計算: 
高度な統計モデリング基本的なデータ分析とモデリングRe: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできませんデータがなければ何が問題なのかを見極めるのは難しいので、何を議論しているのか例を挙げていただけますか?
ありがとう、
ベン
Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできませんこんにちは、ベン。
ご返信ありがとうございます!以下は私が扱っている数値です。Y軸に「平均シグナル列1と2」、X軸に「理論濃度」を当てはめようとしている単純な希釈系列です。重み付けの列は、元の投稿で上記の式を使用して作成したものです。非線形モデルで分析したところ、4PLは当てはまりませんでした(重み付けを外すと当てはまりました)。



Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできませんこんにちは@CurseOfCheetah8 さん、
L4P は重み付けによって意図したとおりに機能しているように見えますが、重み付けされたデータが 4 パラメータ モデルに適合していないためにうまく機能していません。これはパラメータ推定値テーブルで確認できます。

お使いのソフトウェアの式がJMPの式と異なる可能性がありますか?もしそうなら、その式をJMPにインポートして非線形プラットフォームを試してみてください。
相違点がある場合はお知らせください。さらに役立つリソースをお送りします。
ありがとう、
ベン
Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできません応答が濃度の変化に対して本質的に線形である場合、このデータを任意の 4PLC を使用してモデル化することは合理的ですか?

Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできません線形近似は重み付け方法に合致すると思います。残念ながら、これは1/y^2の重み付けで4PLを使用するよう指定されている事前検証済みのアッセイなので、解析方法が限られています。2つのソフトウェア(MSD WorkBenchとJMP)間で4PLの値がこれほど異なる理由を理解しようとしています。ご協力ありがとうございます。次のステップとしては、もう一方のソフトウェアで使用されている式を確認することが挙げられます。
Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできませんこんにちは@CurseOfCheetah8 : ここを見ると、MSD WorkBench が何をしているかがわかります。
https://www.mesoscale.com/~/media/files/manuals/discovery%20workbench%20v4%20users%20guide.pdf?la=en
MSDWでは、下記に記載されている「米国薬局方:USP <1034>」を使用しています。JMPでは、「欧州薬局方」を使用しています。
https://www.quantics.co.uk/blog/what-is-the-4pl-formula/
したがって、それらは異なる方法でパラメータ化されます。
そうは言っても...あなたのデータに関しては、プロトコルに何が書かれていても、4PL モデルを放棄します (つまり、データは 4PL モデルのシグモイド形状にほとんど従いません)。
また、「このプレートは別のソフトウェアで解析済みです」と仰っていますが、「大丈夫」とは具体的にどういう意味ですか?
編集: ここでも良い議論があります。
https://community.jmp.com/t5/Discussions/4PL-fit-4-parameter-logistic/td-p/15836
Re: 重み付け(1/y^2)を適用した後、4PL曲線をフィッティングできませんこんにちは@CurseOfCheetah8 さん、
MesoからJMPに式を取り込んで(こちらの式列をご覧ください)、非線形プラットフォームで実行してみました。収束はしますが、適合性は低いようです。他のソフトウェアで各パラメータについて出力された推定値を見てみたら、似たような値になっているでしょうか?NLが適切に収束するには、各パラメータに適切な範囲を設定する必要があるかもしれません。
ありがとう、
ベン