Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Sto cercando di analizzare un set di dati che utilizza punti segnale grezzi (y, risposta) e concentrazione (x, formula predittiva) per un test di tipo ELISA utilizzando un modello logistico 4P sui dati. Una volta applicata una ponderazione 1/y^2 alla colonna dei punti segnale grezzi, il grafico non si adatta più, dando un R = ~0,45. Questa stessa piastra è stata analizzata con un altro software, quindi mi chiedo cosa stia succedendo. Ogni aiuto è apprezzato!
calcolo della ponderazione: 
Modellazione statistica avanzataAnalisi e modellazione dei dati di baseRe: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)È difficile capire qual è il problema senza dati. Potresti fare un esempio di ciò di cui stai parlando?
Grazie,
Ben
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Ciao Ben,
Apprezzo la tua risposta! Di seguito i numeri con cui sto lavorando. Si tratta di una semplice serie di diluizioni che sto cercando di adattare con le "colonne del segnale medio 1 e 2" sull'asse Y e la "Concentrazione Teorica" come X. La colonna di ponderazione deriva dall'utilizzo della formulazione precedente nel post originale. Dopo l'analisi con un modello non lineare, la 4PL non si adatta (lo fa quando si rimuove la ponderazione).
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Ciao @CurseOfCheetah8 ,
L4P sembra funzionare come previsto con la ponderazione, ma ha difficoltà perché i dati ponderati non sono adatti a un modello a 4 parametri, come si può vedere nella tabella delle stime dei parametri:
Potrebbe essere che l'equazione nel tuo software sia diversa da quella utilizzata da JMP. In tal caso, potresti provare a importarla e utilizzare la piattaforma non lineare.
Fatemi sapere se ci sono differenze e potrò inviarvi altre risorse per aiutarvi.
Grazie,
Ben
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)È ragionevole modellare questi dati con qualsiasi 4PLC quando la risposta è essenzialmente lineare alla variazione di concentrazione?
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Sono d'accordo che l'adattamento lineare funzioni con il modo in cui questo è ponderato. Sfortunatamente, questo è un test pre-validato che specifica di utilizzare un 4PL con una ponderazione 1/y^2, quindi sono limitato nelle mie possibilità di analisi. Sto cercando di capire perché un 4PL apparirebbe così diverso tra due software (MSD WorkBench e JMP). Grazie per il tuo aiuto, sembra che il prossimo passo per me sia provare a vedere quale equazione sta usando l'altro software.
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Ciao @CurseOfCheetah8 : Guardando qui possiamo vedere cosa sta facendo MSD WorkBench.
https://www.mesoscale.com/~/media/files/manuals/discovery%20workbench%20v4%20users%20guide.pdf?la=it
MSDW utilizza quanto di seguito indicato come "Farmacopea degli Stati Uniti: USP <1034>". JMP utilizza quanto di seguito indicato come "Farmacopea europea".
https://www.quantics.co.uk/blog/what-is-the-4pl-formula/
Quindi sono parametrizzati in modo diverso.
Detto questo... per i tuoi dati, abbandonerei il modello 4PL indipendentemente da ciò che dice il tuo protocollo (vale a dire, i dati non seguono minimamente la forma sigmoide del modello 4PL).
Inoltre, dici "Questa stessa lastra è stata analizzata con un altro software, ok". Cosa intendi esattamente con "ok"?
Modifica: anche qui c'è una bella discussione.
https://community.jmp.com/t5/Discussions/4PL-fit-4-parameter-logistic/td-p/15836
Re: Impossibile adattare una curva 4PL dopo aver applicato la ponderazione (1/y^2)Ciao @CurseOfCheetah8 ,
Ho provato a importare la formula da Meso a JMP (guarda la colonna delle formule qui) e a eseguirla sulla piattaforma non lineare: converge, anche se il risultato è scarso in termini di adattamento. Dai un'occhiata ai valori stimati che il tuo altro software ha prodotto per ciascun parametro: sono simili? Potrebbe essere necessario impostare intervalli adeguati per ciascun parametro affinché NL converga correttamente.
Grazie,
Ben
