変更されたウィンドウや保存されていないウィンドウに、ウィンドウリストに注釈を追加します(例:接頭辞 * または接尾辞 (*))。これにより、現在開いているウィンドウに変更が加えられたかどうかをユーザーが把握しやすくなります。
これを環境設定に入れて、注釈を適用するウィンドウの種類 (プロジェクト、ジャーナル、レポート、データテーブル、スクリプト ウィンドウなど) を選択できるようにしてほしいと思います。