プロテオミクス実験の解析を行っています。タンパク質濃度のデータセットは2つあります。1つは日中（午前と午後の比較）で、もう1つは経時的（0日目、30日目、90日目の比較）です。日中データでは、600種類のタンパク質を解析対象としています。経時的データでは、68種類のタンパク質を解析対象としています。各タンパク質の時点間の変化の大きさを調べたいので、Zスコアを求めています。私はこの種の研究を始めたばかりの学生で、統計解析は初めてなので、自分のやり方が正しいのか確信が持てません。
日中データセットのZスコアを求めるために、添付のExcelにある「日中」データをJMPに入力しました。JS値は、正規性を求めるためのジョンソン変換値です。その後、以下の手順を実行しました。
- ジョンソン変換データを取得 --> Y を X でフィッティング --> Y = JS 値、X = 時間、By = タンパク質名 --> グラフを取得 --> 赤い三角 --> ノンパラメトリック --> 正確検定 --> ウィルコキシン正確検定
- 私のデータは次のようになりました:
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- そこから、次の操作を実行しました: Wilcoxin 2サンプル検定、正規近似値を参照 -->右クリック -->結合テーブルを作成 --> Zスコアを参照 --> Excelに貼り付け
- すると、データは次のようになりました。
- 以下は、「Z」タブの日間データの Z スコアの一部です。
問題は、縦断的データに対して同じ方法でZスコアを取得できないことです。おそらく、2つの時点ではなく3つの時点を比較しているため、単純なFit Y by X（私が知る限り）が実行できないためです。JMPを使用して、上記の日中データと同様に、縦断的データセットで各タンパク質のZスコアを取得する方法について、ご意見をいただければ幸いです。
どうもありがとう
