Per contestualizzare, sto eseguendo analisi su un esperimento di proteomica. Ho due set di dati: Intraday (confronto tra AM e PM) e Longitudinal (confronto tra il giorno 0, il giorno 30 e il giorno 90) per la concentrazione proteica. Per l'Intraday, sto analizzando 600 proteine. Per l'analisi Longitudinal, ne ho 68. Voglio scoprire l'entità della variazione tra i punti temporali per ciascuna proteina, quindi sto cercando di calcolare i punteggi z. Sono nuovo alle analisi statistiche, essendo uno studente alle prime armi con questo tipo di ricerca, quindi non sono completamente sicuro di ciò che sto facendo.
Per calcolare gli Z-score per il set di dati Intraday, ho inserito i dati "Intraday" nel file Excel allegato qui sotto in JMP. Il valore JS è il valore di Johnson trasformato per normalità. Ho quindi seguito questi passaggi:
- Prendi i dati trasformati di Johnson --> Adatta Y per X --> Y = valore JS, X = tempo, Per = nome della proteina --> Ottieni grafici --> Triangolo rosso --> Non parametrico --> Test esatto --> Test esatto di Wilcoxin
- I miei dati apparivano così:
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- Da lì, ho fatto: vedere il test di Wilcoxin a 2 campioni, approssimativo normale --> clic destro --> creare una tabella combinata --> vedere i punteggi z --> incollare in Excel
- Quindi i miei dati apparivano così:
- Ecco alcuni dei punteggi z per i dati intraday nella scheda "Z".
Il mio problema è che non riesco a usare lo stesso metodo per ottenere gli z-score per i miei dati longitudinali, probabilmente perché ora sto confrontando 3 punti temporali invece di 2, quindi non posso fare un semplice adattamento Y per X (che io sappia). Gradirei qualsiasi feedback su come utilizzare JMP per ottenere gli z-score per ciascuna proteina come quelli mostrati sopra per Intraday, ma per il set di dati longitudinale.
Grazie mille
