Pour situer le contexte, je réalise des analyses sur une expérience de protéomique. Je dispose de deux jeux de données : intrajournalière (comparant les données du matin et du soir) et longitudinale (comparant les données du jour 0 au jour 30 et du jour 90) pour la concentration en protéines. Pour les données intrajournalières, j'analyse 600 protéines. Pour les données longitudinales, j'en analyse 68. Je souhaite déterminer l'ampleur de la variation entre les points temporels pour chaque protéine, et j'essaie donc de calculer les scores z. Je suis novice en analyses statistiques, car je suis étudiant et je ne suis pas totalement sûr de ce que je fais.
Pour calculer les scores Z des données intrajournalières, j'ai saisi les données intrajournalières du fichier Excel ci-dessous dans JMP. La valeur JS correspond aux valeurs transformées par Johnson pour la normalité. J'ai ensuite suivi les étapes suivantes :
- Prendre les données transformées par Johnson --> Ajuster Y par X --> Y = valeur JS, X = temps, Par = nom de la protéine --> Obtenir des graphiques --> Triangle rouge --> Non paramétrique --> Test exact --> Test exact de Wilcoxin
- Mes données ressemblaient à ceci :
-
- À partir de là, j'ai fait : Voir le test de Wilcoxin à 2 échantillons, normal env. --> clic droit --> Créer un tableau combiné --> Voir les scores z --> Coller dans Excel
- Ensuite, mes données ressemblaient à ceci :
- Voici quelques-uns des scores z pour les données intrajournalières sous l'onglet « Z ».
Mon problème est que je ne peux pas utiliser la même méthode pour obtenir les scores z de mes données longitudinales, probablement parce que je compare désormais trois points temporels au lieu de deux. Je ne peux donc pas effectuer un simple ajustement Y par X (à ma connaissance). J'apprécierais tout commentaire sur la façon d'utiliser JMP pour obtenir les scores z de chaque protéine, comme indiqué ci-dessus pour les données intrajournalières, mais pour l'ensemble de données longitudinales.
Merci beaucoup
