JMP中的GCA/SCA分析我的一位客戶提出了以下問題。如果有人對此有任何意見,我將不勝感激。
我的一個主要問題是
使用 JMP 進行 GCA/SCA 分析。此分析的模型如下:
Y = 基因型 + 誤差,其中
基因型 = 0.5*(女性效應) +
0.5*(男性效應)+(特定組合效應)。
需要的實驗類型
此分析可以是雙列實驗,其中可以使用相同的自交系
既是男性又是女性。
回覆:JMP 中的 GCA/SCA 分析嗨,皮特,
縮寫:GCA(一般配合力)和SCA(特殊配合力)
JMP 或 JMP Genomics 中沒有可以進行此類分析的功能。不過 SAS 可以。所以…如果有人擁有 JMP Genomics 或 JMP 並能存取 SAS,他們就可以做到這一點,並使用 JMP 的功能來創建視覺化效果。也許有人可以開發一個插件,在 SAS 中進行分析。
以下是生命科學發展小組的 Luciano Silva 向我提供的一些參考:
棉花雙列雜交產量及其組成因素的配合力分析:生物學報,2015,7(1):72-80。
DIALLEL-SAS05:Griffing 和 Gardner-Eberhart 分析的綜合程序:農業雜誌;2005 年 7/8 月;97,4;第 1097 頁
雙列交配設計分析:Fikret Isik,2009
希望有幫助。