JMP中的GCA/SCA分析我的一位客户提出了以下问题。如果有人对此有任何意见,我将不胜感激。
我的一个主要问题是
使用 JMP 进行 GCA/SCA 分析。此分析的模型如下:
Y = 基因型 + 误差,其中
基因型 = 0.5*(女性效应) +
0.5*(男性效应)+(特定组合效应)。
需要的实验类型
该分析可以是双列实验,其中可以使用相同的自交系
既是男性又是女性。
回复:JMP 中的 GCA/SCA 分析嗨,皮特,
缩写:GCA(一般配合力)和SCA(特殊配合力)
JMP 或 JMP Genomics 中没有可以进行此类分析的功能。不过 SAS 可以。所以……如果有人拥有 JMP Genomics 或 JMP 并能访问 SAS,他们就可以做到这一点,并使用 JMP 的功能来创建可视化效果。也许有人可以开发一个插件,在 SAS 中进行分析。
以下是生命科学发展小组的 Luciano Silva 向我提供的一些参考资料:
棉花双列杂交产量及其构成因素的配合力分析:生物学报,2015,7(1):72-80。
DIALLEL-SAS05:Griffing 和 Gardner-Eberhart 分析的综合程序:农学杂志;2005 年 7/8 月;97,4;第 1097 页
双列交配设计分析:Fikret Isik,2009
希望有帮助。