JMPでのGCA/SCA分析お客様から以下の質問をいただきました。もし何かご意見がありましたら、ぜひお聞かせください。
私の大きな疑問の一つは、
JMPを用いてGCA/SCA分析を行う。この分析のモデルは以下のとおりである。
Y = 遺伝子型 + 誤差、ここで
遺伝子型 = 0.5*(女性の影響) +
0.5*(男性効果) + (特定の組み合わせ効果)。
実験の種類
この分析は、同じ近親交配種を使用できるダイアレル実験である可能性がある。
男性としても女性としても。
JMPでのGCA/SCA分析についてこんにちは、ピート。
頭字語: GCA (一般結合能力) および SCA (特定結合能力)
JMPやJMP Genomicsには、この分析を実行できる機能はありません。ただし、SASでは可能です。つまり、JMP GenomicsかJMPをお持ちで、SASにもアクセスできる人がいれば、JMP側の機能を使ってSASで分析を行い、図表を作成できるはずです。もしかしたら、SASで分析を行うアドインを作成できるかもしれません。
以下は、ライフ サイエンス開発グループの Luciano Silva から提供された参考資料です。
綿花のダイアレル交配における収量とその構成要素の組合せ能力：Not Sci Biol、2015、7(1):72-80。
DIALLEL-SAS05: グリフィングおよびガードナー・エバーハート分析のための包括的プログラム：農業ジャーナル、2005年7月/8月、97、4、1097ページ
ダイアレル交配デザインの分析：Fikret Isik、2009
お役に立てれば幸いです。
