Analisi GCA/SCA in JMPHo ricevuto la seguente domanda da uno dei miei clienti. Se qualcuno ha qualche suggerimento in merito, gli sarei molto grato.
Una delle mie domande principali è come
Per eseguire un'analisi GCA/SCA utilizzando JMP. Il modello per questa analisi è:
Y = Genotipo + Errore, dove
Genotipo = 0,5*(Effetto femminile) +
0,5*(Effetto maschile) + (Effetto combinato specifico).
Il tipo di esperimento che richiede
questa analisi può essere un esperimento diallelico, in cui può essere utilizzato lo stesso incrocio
sia come Maschio che come Femmina.
Re: Analisi GCA/SCA in JMPCiao Pete,
Acronimi: GCA (capacità di combinazione generale) e SCA (capacità di combinazione specifica)
Non c'è nulla in JMP o JMP Genomics che possa eseguire questa analisi. Tuttavia, è possibile farlo in SAS. Quindi... se qualcuno avesse JMP Genomics o JMP e accesso a SAS, potrebbe farlo e usare il lato JMP per creare le visualizzazioni. Forse qualcuno potrebbe creare un componente aggiuntivo per eseguire l'analisi in SAS.
Ecco alcuni riferimenti che mi sono stati forniti da Luciano Silva del gruppo Sviluppo delle scienze della vita:
Combinazione della capacità di resa e dei suoi componenti negli incroci diallelici del cotone: Not Sci Biol, 2015, 7(1):72-80.
DIALLEL-SAS05: Un programma completo per le analisi di Griffing e Gardner-Eberhart: Agronomy Journal; luglio/agosto 2005; 97, 4; pag. 1097
Analisi dei progetti di accoppiamento diallelico : Fikret Isik, 2009
Spero che questo ti sia d'aiuto.
