GCA/SCA-Analyse in JMPIch habe von einem meiner Kunden die folgende Frage erhalten. Wenn jemand dazu etwas beitragen kann, würde ich mich sehr über das Feedback freuen.
Eine meiner wichtigsten Fragen ist, wie
um eine GCA/SCA-Analyse mit JMP durchzuführen. Das Modell für diese Analyse ist:
Y = Genotyp + Fehler, wobei
Genotyp = 0,5*(Weiblicher Effekt) +
0,5*(Männlicher Effekt) + (Spezifischer Kombinationseffekt).
Die Art des Experiments erfordert
Diese Analyse kann ein dialleles Experiment sein, bei dem die gleiche Inzucht verwendet werden kann
sowohl als männlich als auch als weiblich.
Betreff: GCA/SCA-Analyse in JMPHallo Pete,
Akronyme: GCA (allgemeine Kombinationsfähigkeit) und SCA (spezifische Kombinationsfähigkeit)
JMP oder JMP Genomics bieten keine Möglichkeit, diese Analyse durchzuführen. SAS hingegen schon. Wer also JMP Genomics oder JMP und Zugriff auf SAS hat, kann dies tun und die Visualisierungen mit JMP erstellen. Vielleicht kann jemand ein Add-In für die Analyse in SAS erstellen.
Hier sind einige Referenzen, die mir von Luciano Silva in der Life Sciences Development-Gruppe zur Verfügung gestellt wurden:
Kombination der Ertragsfähigkeit und ihrer Komponenten in diallelen Kreuzungen von Baumwolle: Not Sci Biol, 2015, 7(1):72-80.
DIALLEL-SAS05: Ein umfassendes Programm für Griffing- und Gardner-Eberhart-Analysen: Agronomy Journal; Juli/Aug. 2005; 97, 4; S. 1097
Analyse dialleler Paarungsmuster : Fikret Isik, 2009
Hoffe, das hilft.
