Analyse GCA/SCA dans JMPUn de mes clients m'a posé la question suivante. Si vous avez des commentaires à ce sujet, j'apprécierais grandement vos retours.
L’une de mes principales questions est de savoir comment
Effectuer une analyse GCA/SCA avec JMP. Le modèle utilisé est :
Y = Génotype + Erreur, où
Génotype = 0,5*(effet féminin) +
0,5*(Effet mâle) + (Effet de combinaison spécifique).
Le type d’expérience nécessitant
cette analyse peut être une expérience diallèle, dans laquelle le même consanguin peut être utilisé
à la fois homme et femme.
Objet : Analyse GCA/SCA dans JMPSalut Pete,
Acronymes : GCA (capacité de combinaison générale) et SCA (capacité de combinaison spécifique)
JMP ou JMP Genomics ne permettent pas cette analyse. En revanche, elle est possible avec SAS. Ainsi, si vous possédez JMP Genomics ou JMP et avez accès à SAS, vous pourriez utiliser JMP pour créer les visuels. Peut-être pourriez-vous créer un module complémentaire pour effectuer l'analyse dans SAS.
Voici quelques références qui m'ont été fournies par Luciano Silva du groupe Développement des Sciences de la Vie :
Combinaison de la capacité de rendement et de ses composants dans les croisements diallèles du coton : Not Sci Biol, 2015, 7(1):72-80.
DIALLEL-SAS05 : Programme complet d'analyses de Griffing et de Gardner-Eberhart : Agronomy Journal ; juil./août 2005 ; 97, 4 ; p. 1097
Analyse des modèles d'accouplement diallèle : Fikret Isik, 2009
J'espère que cela aide.
