마커 통계에서 이중대립 유전자 마커 요구 사항 이해에 도움주의: 저는 유전학에 대해 고등학생 수준의 이해만 가지고 있으며 전문가에게는 간단한 내용에 대해 혼란스러워할 수도 있습니다.
방금 생물학 교수님 두 분과 통화를 했는데, 하디-바인버그 평형 검정을 어떻게 하는지 알고 싶어 하셨어요. ("간단해!"라고 생각하며 통화를 시작했죠.) 그런데 통화 중에 Marker Statistics에서 나오는 이 오류 메시지에 대해 구체적으로 물어봤어요.
이들의 데이터는 다중 대립유전자 마커(AA, BB, CC, AB, AC 또는 BC의 유전자형, 숫자로 0~5로 코딩)가 있는 이배체 꽃에서 얻은 것이며, 문서에 따르면 마커 통계는 이중 대립유전자 마커(AA, BB 또는 AB의 유전자형)만 처리할 수 있습니다.
몇 가지 질문이 있습니다.
- 제가 이해한 바에 따르면 Marker Statistics가 해당 상황을 처리할 수 없고, 이것이 해당 오류 메시지의 출처인가요?
- 1번 질문에 대한 답이 "예"인 경우, "마커 통계에서 다중 대립유전자 마커를 처리할 수 없는 이유는 무엇입니까?"라고 묻는 사용자에게 권장하는 답변이 있습니까?
이 문제로 @크리스_키르히버그 님께 특별히 문의드립니다. 다른 분들도 참여해 주실 수 있을 것 같습니다. 감사합니다.
Re: 마커 통계에서 이중대립 유전자 마커 요구 사항 이해에 도움안녕하세요 @Ross_Methusalem ,
이배체에 대한 이중대립 유전자 마커만 처리할 수 있습니다. 0개의 동형접합 주요 대립유전자, 1개의 이형접합, 2개의 동형접합 부대립유전자가 있습니다. 주요 대립유전자와 부대립유전자는 발생 빈도를 나타냅니다. 이배체에 대한 발레릭 마커로 제한한 이유를 알아보려면 Luciano Silva에게 문의해 보세요.
Re: 마커 통계에서 이중대립 유전자 마커 요구 사항 이해에 도움마커 통계는 이중대립 유전자 마커만 허용합니다. 이유는 무엇일까요? 플랫폼에서 HWE, LD 및 기타 측정에 사용되는 공식은 모두 이중대립 유전자에만 적용되기 때문입니다.
해결 방법은 다중대립유전자에서 이중대립유전자 마커를 만드는 것입니다.어떻게?각 마커에 대해 한 번에 하나씩 대립유전자를 취하고 그에 대한 새로운 이중대립유전자 마커를 만듭니다.예를 들어, AA, AB, AC, BC, CC 및 DD 유전자형을 가진 마커가 있다고 가정합니다.대립유전자 A로 시작하여 각 샘플을 살펴보고 A의 사본이 두 개이면 2라고 부르고(AA), 대립유전자 A의 사본이 하나이면 1이라고 부르고(AB 및 AC), 그렇지 않으면(CC 및 DD) 0이라고 부릅니다.대립유전자 B, C 및 D에 대해서도 같은 작업을 수행합니다.각 마커에 대해 대립유전자의 수만큼 이중대립유전자 마커가 있다는 점에 유의하십시오(이 예에서는 대립유전자가 4개이므로 이중대립유전자 마커가 4개입니다).모든 마커에 대해 샘플을 수행합니다.결국 마커 통계에 사용할 수 있는 모든 이중대립유전자 마커를 얻게 됩니다.
Re: 마커 통계에서 이중대립 유전자 마커 요구 사항 이해에 도움고맙습니다, 루시아노와 크리스!
루치아노 님, 말씀하신 해결 방법이 타당해 보입니다. 사용자분들께 전달해 드리겠습니다.
