전형적인 진단 검사는 "황금 표준"또는 알려진 결과를 기반으로 정확하게 대상을 분류하기위한 목적으로 긍정적이거나 부정적인 두 가지 결과를 나타냅니다. 이 진단 테스트는 테스트의 임상 적 가치를 평가하는 데 사용되는 구체적인 성능 측정 값을 가지고 있습니다. 진단 검사에 대한 두 가지 기본 척도는 민감도와 특이도입니다. 민감도는 테스트에서 양성 반응을 보인 진정한 양성 반응의 백분율이며, 특이성은 검사로 음성을 보인 음성 반응의 백분율입니다. FDA의 지침에 명시된 추가적인 관심 측정도 있습니다. 진단 검사 평가 연구 보고서 결과에 대한 통계 지침 . 이러한 성능 측정은 2x2 우발적 인 진실성 표 (즉, 알려진 표준에 의한 진단 - 종종 침입 성)와 테스트 결과를 기반으로합니다.
예를 들어, Zhou, et. al. ( 진단 의학의 통계 방법 , Wiley 2002).
우리의 데이터 테이블에는 "진실"과 "테스트 결과"라는 두 개의 열이 있습니다. Y = 진리와 X = 테스트 결과가있는 X 플랫폼에 맞는 Y를 사용하여 우연 테이블을 얻을 수 있습니다 (아래 그림 참조). 이 우발성 표를 사용하여 우리는 성과 측정치를 수집 할 수 있습니다.
민감도는 우리의 테스트에서 양성 반응을 보이는 진정한 긍정 반응의 비율입니다. 이 예에서는 29/30 또는 표의 Col % 값 96.67입니다. 또 다른 성능 척도는 음의 예측 가치 또는 NPV입니다. NPV는 부정적으로 테스트하는 부정적 테스트의 비율입니다. 이 예에서 NPV는 11/12 또는 행 비율이 91.67입니다. 따라서 우리가 어디를 봐야하는지 알면 진단 결과는 우발 치 테이블에 있습니다. 그러나 그들의 신뢰 구간이 누락되었습니다. 신뢰 구간을 얻으려면 각 성과 지표에 대해 올바른 하위 집합의 하위 집합을 사용하는 한 배포 플랫폼을 사용할 수 있습니다. 감도는 진정한 긍정에 근거합니다. 네거티브를 테스트하는 사람들에 대한 NPV 등등.
정기적으로 성능 측정이 필요하고 명확한 형식으로 다른 사람들과 공유해야 할 필요가 있으므로 JSL로 전환했습니다. 이제 JMP 추가 기능 "성능 측정" 한 곳에서 진단 테스트에 필요한 모든 요약 통계를 가지고 있습니다. 추가 기능을 호출하면 진단 열 (예 : true 결과)과 테스트 결과 열 (예 : 테스트 결과)을 입력하는 대화 상자가 표시되며 그룹화 열이있는 경우 그것도 사용하십시오. 또한 대화 상자에서 신뢰 구간에 대한 유의 수준을 설정할 수 있습니다.
다음은 긍정적 인 테스트에 해당하는 수준을 묻는 메시지가 표시됩니다. 2x2 테이블을 양 / 음 셀인 왼쪽 위 셀의 "표준"형식으로 만들려면 열 속성 "값 순서 지정"을 사용하여 긍정적 인 결과를 최상으로 설정해야합니다 각 열의 값.
결과 출력은 다음과 같습니다.
출력은 필자가 가장 자주 필요했던 것, 즉 2x2 테이블 수와 신뢰 구간을 사용한 성능 측정 테이블로 작성되었습니다. 필자는 그래픽 지향적 인 JMP 플랫폼의 정신을 유지하기 위해 출력물에 그래픽을 유지했습니다. 스크립트는 범주 모델링 플랫폼을 사용하여 2x2 테이블과 빈도 차트를 얻은 다음 2x2 테이블의 값을 참조하여 성능 측정 값 테이블을 생성합니다. 신뢰 구간은 문서의 방법에 기반한 우도 비율에 대한 신뢰 구간을 제외한 점수 신뢰 구간입니다. "신뢰도와의 우도 비 : 진단 테스트 연구를위한 샘플 크기 추정" J Clin Epidemiol . 1991; 44 (8) : 763-70. Simel DL, Samsa GP, Matchar DB.
성능 측정 스크립트는 스크립트의 일부로 사용할 수 있습니다. "의료 진단 도구"추가 기능 JMP 파일 교환 (다운로드하려면 무료 SAS 로그인 필요). 지금까지이 도구 키트에는 위에서 설명한 것과 ROC 곡선에서 AUC의 신뢰 구간을 계산하는 두 가지 도구가 있습니다.
제프 퍼킨슨 쓴 :
안 업데이트 된 버전 이 추가 기능의 최근 게시일 : JMP 파일 교환 .
토마스 패슬러 쓴 :
이 블로그에서 설명한 의료 진단 도구를 찾으려고했지만 데이터베이스에서 제거 된 것 같습니다. 의견 있으십니까? 매우 감사합니다
안녕하세요. 이 추가 기능은 JMP Pro 14에서 작동합니까? 고마워, 빌
안녕 빌,
최신 버전 (2016 년에 업데이트 됨)을 보유하고있는 한 정상적으로 작동합니다 (저에게 적합합니다). 관심있는 모델 분류 임계 값을 탐색하는 추가 기능을 찾을 수도 있습니다. 위 도구와 대화식 그래픽이 포함되어 있습니다.
블로그 및 추가 기능 링크
https://community.jmp.com/t5/JMP-Add-Ins/Exploring-Model-Classification-Thresholds/ta-p/66964
데모로 이야기 해보기
https://community.jmp.com/t5/Discovery-Summit-2018/Beyond-ROC-Curves-Finding-Meaning-and-Balancing-Trade-Offs-US/ta-p/73708
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