Ciao a tutti!
Ho eseguito un test PLS-DA per un set di dati composto da dati spettrali FTIR di 5 sistemi diversi sottoposti a 5 trattamenti diversi. Ho utilizzato la piattaforma di modellazione per poter gestire le variabili categoriali nelle mie variabili Y. Secondo le statistiche PRESS, questo modello ha un numero ottimale di fattori pari a 7 e possiede un buon potere discriminante tra i miei campioni.
Poi, ho notato che le statistiche fornite dall'interfaccia del menu sono correlate alla convalida incrociata (PRESS, van der Voet, ecc.). Per scopi interni, ho dovuto eseguire un test di permutazione per verificare la significatività statistica del modello (ovvero che il potere discriminante del modello non sia dovuto solo al caso). Idealmente, avrei dovuto costruire un grafico come quello allegato (crediti per l'immagine a Daniloski et al., 2022).
Ho provato a farlo utilizzando il metodo multivariato > minimi quadrati parziali e poi compilando la casella di convalida con una colonna di convalida che ho creato utilizzando l'opzione "Crea colonna di convalida K fold" nella modellazione predittiva (in questo caso, ho creato variabili fittizie per sostituire le mie variabili categoriali per il modello continuo, in modo che la piattaforma possa gestirle). Facendo ciò, la prima cosa che ho notato è che il numero di fattori statisticamente significativi in questo modello è ora 5 (rispetto ai precedenti 7) e la capacità discriminante è diminuita sostanzialmente. Inoltre, non so ancora come realizzare il grafico di Daniloski et al., 2022.
Apprezzerei molto se qualcuno potesse spiegarmi come fare, idealmente mantenendo i 7 fattori (ovvero costruendo il modello tramite la piattaforma del modello di adattamento e utilizzando variabili categoriali), poiché quel modello ha discriminato meglio tra i miei campioni.
Grazie in anticipo.
Mariana
