Tabulate non produce l'output previstoCiao a tutti
Ho un sacco di tabelle di dati contenenti dati genomici. Ognuna ha un numero variabile di colonne con il nome del gene snp come nome della colonna e le risposte nominali sono 0, 1 o 2. Il tipo di dati è nominale. Ogni riga rappresenta un paziente diverso e ho utilizzato tabulate per creare un riepilogo della media di una variabile continua per ogni categoria di 0, 1 o 2.
Un output corretto è quello mostrato nello screenshot 1.
Ma per qualche motivo una tabella dati non inserisce 0, 1 e 2 come colonne nella tabella, ma piuttosto come righe sotto ogni SNP. Sembra lo screenshot 2.
Ho provato a creare uno script di quello corretto per importarlo in quello errato e modificarlo manualmente, ma JMP si blocca ogni volta che provo a farlo. Lo script di tabella corretto dice Riga Tabella (colonne per categorie...) e quello errato dice Riga Tabella (colonne per raggruppamento...)
Inoltre, quando salvo semplicemente lo script da quello corretto dopo aver completato la tabulazione e poi provo a eseguirlo di nuovo, si apre semplicemente una finestra vuota, non una precompilata con i dati che ho usato per generare lo script. E poi JMP si blocca all'improvviso.
Esiste un modo per salvare uno script per creare una tabella senza il formato di raggruppamento delle colonne e per popolare le colonne di dati nello script?
Sto utilizzando JMP 17.0.0 su un computer Mac.
Analisi e modellazione dei dati di baseRe: Tabulate non produce l'output previstoCiao @MaureenS ,
Puoi fornirci un esempio di come appare la tua tabella dati originale, incluso il tipo di dati e il tipo di modellazione per gli SNP (dato che sono colonne)?
Re: Tabulate non produce l'output previstoeccone un frammento come screenshot.
Potrei aver trovato una soluzione alternativa senza provare a usare script. È curioso come quando si consultano le istruzioni (manuale utente online) si impari qualcosa. Ho sempre saputo delle opzioni sotto i triangoli rossi, ma a quanto pare è possibile fare clic con il pulsante destro del mouse sul nome della colonna e ottenere altre opzioni. Una è quella di combinare le tabelle (colonne per categorie). Questo ha funzionato come volevo. A quanto pare il problema erano molti dati mancanti.
Gli utenti Mac tendono a non pensare al clic destro sugli oggetti. È un po' sgradevole che ci siano opzioni nascoste senza alcun indicatore come il triangolo rosso.
Re: Tabulate non produce l'output previstoSì, era proprio quello che dovevo fare. Anche l'ordine delle operazioni aiuta. Quell'opzione non comparirebbe se avessi i tratti in alto come colonne e avessi provato a inserire gli SNP come righe. Quando salvo lo script nella tabella dati e provo a riaprirlo, mi viene mostrata la stessa finestra di tabulazione vuota e si blocca nella versione 17.2.0 e in JMP 18.2.2. Ma in JMP 19.0.0, in arrivo a settembre, non si blocca nulla quando si salva lo script nella tabella dati e la tabella viene popolata correttamente quando si riesegue lo script della tabella.
Continua a bloccarsi e ad aprirsi come una tabella vuota quando si riesegue lo script/script della tabella?
