測試並建立一對多關聯大家好,JMP 社區,
你們有人知道如何測試一對多相關性,而不是使用 Aanalyze 的「多變量」功能嗎?我想快速篩選並產生一個包含 20,000 個基因的面板,其中列出與目標靶點具有強相關性的基因,以及相應的 r 值和 p 值。然後,建立與目標靶點的相關矩陣。非常感謝!
基礎資料分析與建模數據探索與視覺化回覆:測試並建立一對多關聯你好@qunw ,
我認為“Response Screening”平台可能會對您有所幫助。
在您的情況下,該平台使您能夠使用您感興趣的響應 Y 來測試所有 X,並使用適當的穩健測試來控制錯誤發現率(由於進行了大量測試)。
該平台還提供火山圖( 按差異對數圖和按斜率對數圖),常用於基因組學中識別對反應影響最大的基因。
希望這個答案能對你有幫助,
回覆:測試並建立一對多關聯Victor,謝謝你的指導!是的,反應篩選有助於識別統計上顯著的、影響目標反應 Y 的 X。我上面的查詢旨在識別與目標最相關的 X,該目標也是 X 組內的標記。我知道多變量允許建立 n*n 相關矩陣,但我希望看到 X 組中一個 n*n 相關矩陣,以及相應的 r 值和 p 值。對此有什麼建議嗎?非常感謝!
回覆:測試並建立一對多關聯好的,不確定我是否完全明白您的回复,但也許聚類變數平台可能會有幫助?
您將獲得相關性結果的顏色圖,並且集群摘要將能夠將您的變數分組為集群,從而提供集群組件變數(按集群的主要組件)。
但是,該平台沒有顯示 p 值,此資訊可以在多元平台中找到。
如果這個回應仍然無法回答您的問題,您能否用一個玩具資料集、螢幕截圖、預期結果等來精確說明您的目標?
希望這能對你有幫助,
回覆:測試並建立一對多關聯嗨,維克多,
感謝您對這個問題的幫助。以下是一對多關聯輸出的範例:您知道如何使用 JMP 來實現嗎?
非常感謝!

回覆:測試並建立一對多關聯好的,這通常是您在啟動對話方塊中添加一個回應和所有因素時使用平台回應篩選所獲得的輸出類型,帶有一些附加選項(不同的圖),並且由於 Benjamini-Hochberg 技術用於計算 FDR p 值,因此可以更好地防止多重比較錯誤發現率風險,以及其他穩健的計算選項。
如果這不是您想要的,我不明白它缺少什麼或哪些功能無法滿足您的需求。 Fit Y by X平台也支援進行雙變量分析,但考慮到您測試的變數數量,平台可能無法適應,因為這會很繁瑣,而且統計檢定在比較次數方面也無法進行調整。
請注意,如果您想使用從平台提取的資訊自訂圖表,您始終可以在報告中提取資料表(右鍵單擊任何表格報告並選擇「另存為資料表」以獲取 JMP 資料表);例如,從回應篩選報告中提取資訊來繪製您自己的散點圖矩陣,以可視化與 p 值的相關性。
抱歉,如果這個回覆不能滿足您的需求,我別無選擇,
回覆:測試並建立一對多關聯Victor,非常感謝你針對這個問題的所有建議!我還聯繫了 JMP 支援團隊,了解到 JMP 18 中沒有一對多功能,但會將其添加到願望清單中。目前,我已經用 Spotfire 完成了這項功能;如果你也有類似的需求,在新功能上線之前,Spotfire 可以作為 JMP 的補充。