Pruebe y construya correlaciones de UNA a muchasHola comunidad JMP,
¿Alguien sabe cómo probar correlaciones uno a muchos en lugar de usar la función "multivariante" de Aanalyze? Me gustaría analizar y generar rápidamente una lista de los genes principales de un panel de 20 000 genes que tienen fuertes correlaciones con el objetivo de interés, junto con los valores r y p correspondientes. Luego, construir la matriz de correlación con el objetivo de interés. ¡Muchas gracias!
Análisis y modelado de datos básicosExploración y visualización de datosRe: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasHola @qunw ,
Creo que la plataforma Evaluación de respuesta podría serle útil.
En su caso, esta plataforma le permite probar todas sus X con su respuesta de interés Y, con el uso de pruebas robustas apropiadas para controlar la tasa de descubrimiento falso (debido a la gran cantidad de pruebas realizadas).
Los gráficos de volcanes ( Logworth por diferencia y Logworth por pendiente ) también están disponibles en esta plataforma y se utilizan comúnmente en genómica para identificar los genes más impactantes en una respuesta.
Espero que esta respuesta te ayude.
Re: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasGracias, Víctor, por tu explicación. Sí, el Cribado de Respuestas es útil para identificar X estadísticamente significativo que afecta la respuesta de interés Y. Mi consulta anterior busca identificar el X más correlacionado con un objetivo de interés, que también es un marcador dentro del grupo X. Sé que el análisis multivariante permite construir una matriz de correlación n*n, pero me gustaría ver una correlación *n en el grupo X, con sus valores r y p correspondientes. ¿Alguna sugerencia al respecto? ¡Muchas gracias!
Re: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasOk, no estoy seguro de entender completamente tu respuesta, pero ¿quizás la plataforma Variables de clúster podría ser útil?
Tendrá el mapa de colores en los resultados de Correlaciones y el Resumen de clústeres le permitirá agrupar sus variables en clústeres, proporcionando variables de componentes de clústeres (componente principal por clúster).
Sin embargo, no se muestran valores p en esta plataforma, esta información se puede encontrar en la plataforma Multivariante.
Si esta respuesta aún no responde a tu pregunta, ¿podrías precisar tu objetivo, con un conjunto de datos de juguete, capturas de pantalla, resultados esperados, ...?
Espero que esto pueda ayudarte.
Re: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasHola Víctor,
Agradezco tu ayuda con la consulta. Aquí tienes un ejemplo de correlación uno a muchos: ¿Sabes cómo hacerlo con JMP?
¡Muchas gracias!
Re: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasBien, este es típicamente el tipo de resultado que obtendrá con la plataforma Response Screening al agregar una respuesta y todos los factores en el cuadro de diálogo Launch , con algunas opciones adicionales (gráficos diferentes) y con más protección contra el riesgo de tasa de falsos descubrimientos por comparación múltiple gracias a la técnica de Benjamini-Hochberg para calcular el valor p de FDR y opciones de cálculo robustas adicionales.
Si esto no es lo que busca, no entiendo qué falta o qué no se ajusta a sus necesidades. La plataforma Ajustar Y por X también permite realizar análisis bivariados, pero en su caso, en cuanto al número de variables a evaluar, la plataforma podría no ser adecuada, ya que resultaría engorrosa y las pruebas estadísticas no se adaptarían al número de comparaciones realizadas.
Tenga en cuenta que siempre puede extraer tablas de datos en los informes (haga clic con el botón derecho en cualquier informe de tabla y elija "Guardar como tabla de datos" para obtener la tabla de datos JMP), si desea personalizar gráficos con la información extraída de una plataforma; por ejemplo, extraer información del informe de detección de respuestas para trazar su propia matriz de diagrama de dispersión para visualizar correlaciones con valores p.
Lo siento si esta respuesta no responde a tus necesidades, me he quedado sin opciones.
Re: Probar y construir correlaciones de UNA a muchasMuchas gracias, Víctor, por todas tus sugerencias sobre esta consulta. También contacté con el soporte de JMP y descubrí que no tienen una función específica en JMP 18 para Uno a Muchos, pero la añadiré a la lista de deseos. Por ahora, Spotfire lo ha hecho; si tienes necesidades similares, esto complementa a JMP para esta función hasta que se añada la nueva.
