测试并建立一对多关联大家好,JMP 社区,
你们有人知道如何测试一对多相关性,而不是使用 Aanalyze 的“多变量”功能吗?我想快速筛选并生成一个包含 20,000 个基因的面板,其中列出与目标靶点具有强相关性的基因,以及相应的 r 值和 p 值。然后,构建与目标靶点的相关矩阵。非常感谢!
基础数据分析与建模数据探索与可视化回复:测试并建立一对多关联你好@qunw ,
我认为“Response Screening”平台可能会对您有所帮助。
在您的情况下,该平台使您能够使用您感兴趣的响应 Y 来测试所有 X,并使用适当的稳健测试来控制错误发现率(由于进行了大量测试)。
该平台还提供火山图( 按差异对数图和按斜率对数图),常用于基因组学中识别对反应影响最大的基因。
希望这个答案能对你有所帮助,
回复:测试并建立一对多关联Victor,谢谢你的指导!是的,响应筛选有助于识别统计上显著的、影响目标响应 Y 的 X。我上面的查询旨在识别与目标最相关的 X,该目标也是 X 组内的标记。我知道多变量允许构建 n*n 相关矩阵,但我希望看到 X 组中一个 n*n 相关矩阵,以及相应的 r 值和 p 值。对此有什么建议吗?非常感谢!
回复:测试并建立一对多关联好的,不确定我是否完全明白您的回复,但也许聚类变量平台可能会有帮助?
您将获得相关性结果的颜色图,并且集群摘要将能够将您的变量分组为集群,从而提供集群组件变量(按集群的主要组件)。
但是,该平台没有显示 p 值,此信息可以在多元平台中找到。
如果这个回复仍然不能回答您的问题,您能否用一个玩具数据集、屏幕截图、预期结果等来精确说明您的目标?
希望这能对你有帮助,
回复:测试并建立一对多关联嗨,维克多,
感谢您对这个问题的帮助。以下是一对多关联输出的示例:您知道如何使用 JMP 来实现吗?
非常感谢!

回复:测试并建立一对多关联好的,这通常是您在启动对话框中添加一个响应和所有因素时使用平台响应筛选所获得的输出类型,带有一些附加选项(不同的图),并且由于 Benjamini-Hochberg 技术用于计算 FDR p 值,因此可以更好地防止多重比较错误发现率风险,以及其他稳健的计算选项。
如果这不是您想要的,我不明白它缺少什么或哪些功能无法满足您的需求。Fit Y by X平台也支持进行双变量分析,但考虑到您测试的变量数量,该平台可能无法适应,因为这会很繁琐,而且统计检验在比较次数方面也无法进行调整。
请注意,如果您想使用从平台提取的信息自定义图表,您始终可以在报告中提取数据表(右键单击任何表格报告并选择“另存为数据表”以获取 JMP 数据表);例如,从响应筛选报告中提取信息来绘制您自己的散点图矩阵,以可视化与 p 值的相关性。
抱歉,如果这个回复不能满足您的需求,我别无选择,
回复:测试并建立一对多关联Victor,非常感谢你针对这个问题提出的所有建议!我还联系了 JMP 支持团队,了解到 JMP 18 中没有一对多功能,但会将其添加到愿望清单中。目前,我已经用 Spotfire 完成了这项功能;如果你也有类似的需求,在新功能上线之前,Spotfire 可以作为 JMP 的补充。