1대 다수 상관관계 테스트 및 구축안녕하세요 JMP 커뮤니티 여러분,
Aanalyze에서 "다변량" 함수 대신 일대다 상관관계를 검정하는 방법을 아시는 분 계신가요? 2만 개의 유전자 패널에서 관심 대상과 강한 상관관계를 보이는 상위 유전자 목록을 빠르게 선별하고, 그에 해당하는 r값과 p값을 생성하고 싶습니다. 그런 다음 관심 대상과 상관관계 행렬을 구축하고 싶습니다. 감사합니다!
기본 데이터 분석 및 모델링데이터 탐색 및 시각화Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축안녕하세요 @qunw ,
응답 스크리닝 플랫폼이 도움이 될 것 같아요.
귀하의 경우, 이 플랫폼을 통해 관심 있는 Y에 대한 응답으로 모든 X를 테스트할 수 있으며, 적절한 견고한 테스트를 사용하여 허위 발견률(수행된 테스트 수가 많음)을 제어할 수 있습니다.
이 플랫폼에서는 화산 플롯 ( 차이에 따른 로그워스, 기울기에 따른 로그워스 )도 사용할 수 있으며, 일반적으로 유전체학에서 반응에 가장 큰 영향을 미치는 유전자를 식별하는 데 사용됩니다.
이 답변이 도움이 되기를 바랍니다.
Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축Victor, 가르쳐 주셔서 감사합니다! 네, 반응 선별은 관심 반응 Y에 영향을 미치는 통계적으로 유의미한 X를 식별하는 데 유용합니다. 위의 질문은 관심 대상(X 그룹 내의 마커이기도 함)과 가장 상관관계가 높은 X를 식별하는 것을 목표로 합니다. 다변량 분석에서는 n*n 상관 행렬을 구성할 수 있다는 것을 알고 있지만, X 그룹에서 하나의 *n 상관관계와 그에 상응하는 r 및 p 값을 확인하고 싶습니다. 이에 대한 제안이 있으신가요? 감사합니다!
Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축알겠습니다. 답변을 완전히 이해했는지는 잘 모르겠지만, 클러스터 변수 플랫폼이 도움이 될 수도 있을까요?
상관 관계 결과에 대한 색상 맵 과 클러스터 요약을 통해 변수를 클러스터로 그룹화하고 클러스터 구성 요소 변수(클러스터별 주성분)를 제공할 수 있습니다.
하지만 이 플랫폼에는 p값이 표시되지 않습니다. 이 정보는 다변량 플랫폼에서 찾을 수 있습니다.
이 답변으로도 질문에 대한 답이 되지 않는다면, 장난감 데이터 세트, 스크린샷, 예상 결과 등을 포함하여 목표를 구체적으로 설명해 주시겠습니까?
이것이 당신에게 도움이 되기를 바랍니다.
Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축안녕하세요 빅터,
질의에 도움을 주셔서 감사합니다. 일대다 상관관계 출력 예시는 다음과 같습니다. JMP로 어떻게 하는지 아시나요?
감사합니다!
Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축알겠습니다. 이는 일반적으로 플랫폼 응답 스크리닝에서 하나의 응답과 실행 대화 상자 의 모든 요소를 추가하고, 몇 가지 추가 옵션(다른 플롯)과 FDR p값을 계산하는 Benjamini-Hochberg 기법 덕분에 다중 비교의 허위 발견률 위험에 대한 보호가 강화되고, 추가적인 견고한 계산 옵션이 제공되는 경우 얻을 수 있는 출력 유형입니다.
이것이 원하시는 것이 아니라면, 무엇이 누락되었거나 귀하의 요구 사항에 맞지 않는지 이해할 수 없습니다. Y를 X로 맞추기 플랫폼은 이변량 분석도 지원하지만, 귀하의 경우 검정할 변수의 수와 관련하여 플랫폼이 조정되지 않을 수 있습니다. 플랫폼 조정이 번거롭고 수행된 비교 횟수에 대한 통계적 검정이 조정되지 않기 때문입니다.
플랫폼에서 추출한 정보로 플롯을 사용자 정의하려는 경우 보고서에서 항상 데이터 테이블을 추출할 수 있습니다(테이블 보고서에서 마우스 오른쪽 버튼을 클릭하고 "데이터 테이블로 저장"을 선택하여 JMP 데이터 테이블을 가져옵니다). 예를 들어, 응답 스크리닝 보고서에서 정보를 추출하여 p값과의 상관관계를 시각화하기 위한 산점도 행렬을 그릴 수 있습니다.
이 답변이 귀하의 요구에 부응하지 못한다면 죄송합니다. 다른 선택지가 없습니다.
Re: 1대 다수 상관관계 테스트 및 구축Victor, 이 질문에 대한 모든 제안에 정말 감사합니다! JMP 지원팀에 문의해 보니 JMP 18에는 일대다(One-to-Many)에 대한 정확한 기능이 없지만 위시리스트에 추가할 예정이라고 합니다. 지금은 Spotfire를 사용하고 있는데, 혹시 비슷한 문제가 있으시다면 새 기능이 추가될 때까지 이 기능을 JMP에서 Spotfire를 통해 보완해 주시면 감사하겠습니다.
