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Optimización del laboratorio de pregrado con un diseño experimental más inteligente
Nos complace compartir una nueva historia de éxito académico del Grupo de Biocombustibles Microbianos (EMBG) de la Universidad de Exeter, donde JMP está ayudando a investigadores y estudiantes a ampliar los límites de la biología sintética y la bioingeniería.
Resumen del vídeo
- EMBG es un laboratorio de biología sintética que diseña bacterias personalizadas para producir biocombustibles y precursores de bioplásticos.
- JMP se ha convertido en parte integral de su optimización de procesos, desde los protocolos de extracción de proteínas hasta el desarrollo de pruebas de diagnóstico.
- Los investigadores utilizan el diseño de experimentos (DOE) para impulsar la eficiencia en proyectos de pregrado y posgrado, haciendo que el tiempo y los recursos limitados de laboratorio cuenten.
- El laboratorio también aprovecha JMP en competiciones de alto perfil como iGEM, donde los estudiantes aplican JMP a desafíos biológicos del mundo real.
Conclusiones clave
- Optimización rápida: un experimento DOE de medio día rediseñó un protocolo de sonicación de 15 años de antigüedad, aumentando el rendimiento de proteínas tres veces.
- Herramienta de capacitación eficiente: JMP, especialmente Easy DOE, se utiliza para enseñar diseño experimental a estudiantes universitarios con acceso limitado al laboratorio.
- Mejor uso de los recursos: el DOE ayuda a los estudiantes e investigadores a evitar experimentos ineficientes de un factor a la vez, maximizando los datos por ejecución.
- Investigación aplicada estudiantil: los estudiantes de iGEM utilizaron JMP para desarrollar un diagnóstico veterinario para la tuberculosis bovina, logrando una ganancia de sensibilidad de 60 veces en tres iteraciones.
Retorno de la inversión
- Alto rendimiento con menos experimentos: importantes avances de laboratorio logrados en un tiempo mínimo y con recursos limitados.
- Educación rentable: JMP permite que los laboratorios académicos con recursos insuficientes logren mejores resultados experimentales.
- Ciencia reproducible: los experimentos diseñados y analizados en JMP respaldan resultados de investigación confiables y publicables.
Citas de productos:
Mark Hewlett, investigador de la Universidad de Exeter:
- Me esfuerzo mucho para que mis estudiantes de pregrado y posgrado utilicen JMP para maximizar la cantidad de datos experimentales que pueden obtener, y creo que Easy DOE es probablemente la forma más útil de tener una introducción muy sencilla a JMP.
- La herramienta que utilizo con más frecuencia es el Diseño de Experimentos (DOE) para intentar alejarme del diseño experimental de un factor a la vez o completamente factorial. Creo que esto es fundamental, especialmente con estudiantes de pregrado, ya que tienen tan poco tiempo en el laboratorio y recursos financieros tan limitados para su investigación que se busca obtener la mayor cantidad posible de datos de alta calidad con el menor número de experimentos, y creo que ahí es donde el JMP realmente destaca.
- Usamos un sonicador para lisar las células bacterianas y así recolectar la proteína que contienen. Hemos cambiado nuestro sonicador dos veces en los últimos 15 años. Y en cada ocasión, mantuvimos el mismo protocolo. Así que lo sometí a un diseño de cribado. De hecho, obtuve un aumento del triple de proteína utilizable en tan solo 12 experimentos. Fue un trabajo de medio día, muy sencillo, pero marcó una gran diferencia en el tiempo que dedicaba a la lisis y en el rendimiento que obtenía.
