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Ottimizzare il laboratorio universitario con una progettazione sperimentale più intelligente
Siamo entusiasti di condividere una nuova storia di successo accademico del Microbial Biofuels Group (EMBG) dell'Università di Exeter, dove JMP aiuta ricercatori e studenti a superare i confini della biologia sintetica e della bioingegneria.
Riepilogo video
- EMBG è un laboratorio di biologia sintetica che progetta batteri personalizzati per produrre biocarburanti e precursori di bioplastiche.
- JMP è diventato parte integrante dell'ottimizzazione dei loro processi, dai protocolli di estrazione delle proteine allo sviluppo dei test diagnostici.
- I ricercatori utilizzano il Design of Experiments (DOE) per aumentare l'efficienza nei progetti universitari e post-universitari, sfruttando al meglio il tempo e le risorse limitate di laboratorio.
- Il laboratorio sfrutta JMP anche in competizioni di alto profilo come iGEM, dove gli studenti applicano JMP a sfide biologiche del mondo reale.
Punti chiave
- Ottimizzazione rapida: un esperimento DOE di mezza giornata ha riprogettato un protocollo di sonicazione vecchio di 15 anni, aumentando di 3 volte la resa proteica.
- Strumento di formazione efficiente: JMP, in particolare Easy DOE, viene utilizzato per insegnare la progettazione sperimentale a studenti universitari con accesso limitato al laboratorio.
- Miglior utilizzo delle risorse: il DOE aiuta studenti e ricercatori a evitare esperimenti inefficienti che utilizzano un solo fattore alla volta, massimizzando i dati per esecuzione.
- Ricerca applicata degli studenti: gli studenti iGEM hanno utilizzato JMP per sviluppare una diagnosi veterinaria per la tubercolosi bovina, ottenendo un aumento di sensibilità di 60 volte in tre iterazioni.
Ritorno sull'investimento
- Elevata resa con meno esperimenti: significativi miglioramenti di laboratorio ottenuti in tempi minimi e con risorse limitate.
- Formazione conveniente: JMP consente ai laboratori accademici con risorse insufficienti di raggiungere risultati sperimentali più elevati.
- Scienza riproducibile: gli esperimenti progettati e analizzati in JMP supportano risultati di ricerca affidabili e pubblicabili.
Preventivi di prodotto:
Mark Hewlett, ricercatore, Università di Exeter:
- "Cerco con tutte le mie forze di convincere i miei studenti universitari e laureati a usare JMP per massimizzare la quantità di dati sperimentali che possono ottenere e penso che Easy DOE sia probabilmente il modo più utile per avere un'introduzione davvero discreta a JMP."
- Lo strumento più comune che utilizzo è il Design of Experiments (DOE) per cercare di allontanarmi dal disegno sperimentale un fattore alla volta o completamente fattoriale. Credo che sia davvero importante, soprattutto con gli studenti universitari, perché hanno così poco tempo in laboratorio e risorse finanziarie limitate per la loro ricerca che desiderano ottenere il maggior numero possibile di dati di alta qualità con il minor numero di esecuzioni sperimentali, e credo che sia qui che JMP entra davvero in gioco.
- Usiamo un sonicatore per lisare le cellule batteriche in modo da poter raccogliere le proteine al loro interno. Abbiamo cambiato il nostro sonicatore due volte negli ultimi 15 anni. E ogni volta abbiamo mantenuto lo stesso protocollo. Quindi, l'ho sottoposto a un progetto di screening. E ho effettivamente ottenuto un aumento di tre volte delle proteine utilizzabili in soli 12 esperimenti. Quindi, è stato un lavoro di mezza giornata, è stato davvero semplice, ma ha fatto un'enorme differenza nel tempo che dedicavo alla lisi e nella resa che ottenevo.
