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Optimiser le laboratoire de premier cycle grâce à une conception expérimentale plus intelligente
Nous sommes ravis de partager une nouvelle réussite académique du Microbial Biofuels Group (EMBG) de l'Université d'Exeter, où JMP aide les chercheurs et les étudiants à repousser les limites de la biologie synthétique et de la bio-ingénierie.
Résumé de la vidéo
- EMBG est un laboratoire de biologie synthétique qui conçoit des bactéries sur mesure pour produire des biocarburants et des précurseurs de bioplastiques.
- JMP est devenu partie intégrante de l’optimisation de leurs processus, des protocoles d’extraction de protéines au développement de tests de diagnostic.
- Les chercheurs utilisent la conception d'expériences (DOE) pour accroître l'efficacité des projets de premier et de deuxième cycle, en tirant parti du temps et des ressources limités du laboratoire.
- Le laboratoire utilise également JMP dans des compétitions de haut niveau comme iGEM, où les étudiants appliquent JMP à des défis biologiques du monde réel.
Points clés à retenir
- Optimisation rapide : une expérience DOE d'une demi-journée a repensé un protocole de sonication vieux de 15 ans, augmentant le rendement en protéines de 3 fois.
- Outil de formation efficace : JMP, en particulier Easy DOE, est utilisé pour enseigner la conception expérimentale aux étudiants de premier cycle ayant un accès limité au laboratoire.
- Meilleure utilisation des ressources : le DOE aide les étudiants et les chercheurs à éviter les expériences inefficaces à facteur unique à la fois, maximisant ainsi les données par exécution.
- Recherche étudiante appliquée : les étudiants d'iGEM ont utilisé JMP pour développer un diagnostic vétérinaire pour la tuberculose bovine, obtenant un gain de sensibilité de 60 fois en trois itérations.
Retour sur investissement
- Rendement élevé à partir de moins d’expériences : gains de laboratoire significatifs obtenus en un minimum de temps et avec des ressources limitées.
- Éducation rentable : JMP permet aux laboratoires universitaires sous-dotés en ressources d’obtenir des résultats expérimentaux plus élevés.
- Science reproductible : les expériences conçues et analysées dans JMP soutiennent des résultats de recherche fiables et publiables.
Citations sur les produits :
Mark Hewlett, chercheur, Université d'Exeter :
- « Je m'efforce d'inciter mes étudiants de premier et deuxième cycles à utiliser JMP pour maximiser la quantité de données expérimentales qu'ils peuvent obtenir, et je pense que l'Easy DOE est probablement le moyen le plus utile d'avoir une introduction très discrète à JMP. »
- L'outil que j'utilise le plus souvent est le plan d'expériences (DOE) pour m'éloigner du plan expérimental factoriel complet ou à facteur unique. Je pense que c'est très important, surtout pour les étudiants de premier cycle, car ils ont très peu de temps en laboratoire et des ressources financières limitées pour leurs recherches. Il est donc essentiel d'obtenir un maximum de données de haute qualité avec un minimum d'expérimentations. C'est là que JMP prend tout son sens.
- Nous utilisons un sonicateur pour lyser les cellules bactériennes afin de récolter les protéines qu'elles contiennent. Nous avons changé notre sonicateur deux fois au cours des 15 dernières années. Et à chaque fois, nous avons conservé le même protocole. J'ai donc soumis le tout à un test de criblage. Et j'ai obtenu une multiplication par trois de la quantité de protéines utilisables en seulement 12 expériences. Cela m'a pris une demi-journée de travail, c'était très simple, mais cela a fait une énorme différence sur le temps que je consacrais à la lyse et sur le rendement obtenu.
