La carne cultivada con células (o "cultivada en laboratorio") ofrece una alternativa sostenible y sin sacrificio a la ganadería tradicional, mediante el cultivo de células animales en biorreactores. Este campo emergente se nutre de la fabricación biofarmacéutica tradicional, pero requiere menores costos de insumos (especialmente medios de cultivo celular) para alcanzar precios competitivos. En UPSIDE Foods, desarrollamos flujos de trabajo experimentales de alto rendimiento para probar y optimizar rápidamente las formulaciones de medios de cultivo celular. Sin embargo, los grandes conjuntos de datos (más de 2000 mediciones por análisis) crearon un nuevo cuello de botella, donde el procesamiento manual de datos ralentizó los ciclos de iteración y retrasó las decisiones sobre el proceso.
Para solucionar esto, configuramos una Conexión Abierta de Base de Datos (ODBC), que permite el acceso en tiempo real a datos clave de instrumentos (p. ej., ViCell XR/Blu, Nova Flex 2). Posteriormente, desarrollamos herramientas con el lenguaje de script JMP (JSL) para extraer datos a JMP y automatizar nuestros flujos de trabajo de análisis de datos. Esta presentación demuestra la funcionalidad del script, como las visualizaciones de datos integradas (Generador de Gráficos), el análisis automatizado de tendencias (Ajuste Bivariado) y las herramientas de orientación al operador (Tabulación) para guiar las intervenciones del proceso (p. ej., alimentaciones, ajustes de valores de consigna). Nuestro enfoque también permitió realizar cálculos más avanzados que requieren la integración numérica entre puntos de datos con relaciones condicionales. Como caso práctico, utilizo el consumo de glucosa específico de cada célula qGluc (pg/(célula*día)) para destacar tres aspectos críticos de nuestra metodología que facilitaron la automatización de este cálculo, notoriamente laborioso:
- Desarrollar convenciones de nomenclatura de muestras estandarizadas.
- Organizar y limpiar datos automáticamente mediante operaciones como JOIN y SORT.
- Creación de columnas de fórmulas utilizando funciones clave (por ejemplo, SI, RETRASO, FALTA).
La integración de transmisiones de datos en vivo con análisis automatizados en JMP aceleró significativamente el desarrollo de bioprocesos y redujo la latencia de decisiones en UPSIDE Foods.
