¿Qué inspiró esta solicitud de lista de deseos? Describa el problema actual que necesita mejorar o el nuevo problema a resolver que no es fácil o posible en este momento.
Permitir métodos adicionales de normalización de ARN-seq como TMM, RPKM, TPM, KDMM, mediana de proporciones
Describa la característica o solución nueva o mejorada que le gustaría ver.
¿Qué valor tendría para usted y/o para otros usuarios ofrecer esta nueva función?Agradecería cualquier información sobre facilidad de uso, ahorro de tiempo y valor de las nuevas funciones. Si esta función está disponible en otras soluciones de software, descríbala.
Proporcionar métodos comunes de transformación/normalización utilizados para datos de secuenciación de ARN para ayudar en el análisis de estos datos.
Desde el menú Columnas o haciendo clic derecho y seleccionando "Nueva fórmula de columna", proporcione las opciones de transformación que las incluyan. La salida no debe incluir fórmulas de columna en las columnas (estos métodos se aplican a decenas de miles de columnas en cientos de muestras/filas).
¿Es esta una solicitud de un cliente externo?Si es así, proporcione el nombre de la cuenta del cliente y los puntos de contacto clave y los usuarios que realizaron la solicitud.
Sí, USDA-ARS, pero también es común entre quienes trabajan con este tipo de datos. Anteriormente, trabajaba en JMP Genomics. También en Cornell y Cargill.
¿Existe algún paquete de software competitivo que tenga esta característica o solución y que debamos conocer? Proporcione toda la información que pueda sobre software competitivo, incluidos enlaces a sitios web, demostraciones o ejemplos.
R/Bioconductor y otras herramientas de análisis de expresión genética (GeneSpring, Omic Soft, etc.)
¿Esto afectará la renovación, expansión o adopción de un cliente y pondrá en riesgo una cuenta si no abordamos este problema? Proporcione detalles razonables y una descripción del problema específico de la cuenta.
No estoy seguro, pero podría impedir nuevas ventas a organizaciones más pequeñas que no tienen departamentos de bioinformática que puedan generar estos datos para el cliente.
@Chris_Kirchberg : ¡Gracias por tu sugerencia! Hemos recibido tu solicitud y la tendremos en cuenta.
