Hola, estoy realizando un ANOVA factorial completo de 4 vías con un factor de medidas repetidas (tiempo, 3 muestreos) y tres factores intersujetos (especie, color y riego; 2 niveles de cada uno) utilizando el Modelo Mixto de Personalidad en JMP Pro 18.1.0. Utilizo la estructura de covarianza repetida AR(1), ya que ofrece el mejor ajuste según los valores de AICc. El análisis indica que no tengo interacciones significativas de 4 o 3 vías, pero sí múltiples interacciones de 2 vías (véase más abajo).
Para investigar las interacciones bidireccionales, me gustaría, por ejemplo, realizar una separación de medias de Tukey para cada período de tiempo en cada nivel de especie y una prueba t para cada especie en cada período. Sin embargo, no me interesan todas las comparaciones por pares en la interacción especie x período (es decir, comparar la especie 1 en el tiempo 1 con la especie 2 en el tiempo 3 no es significativo) y, en la medida de lo posible, quiero evitar diluir mi potencia estadística. Las estimaciones definidas por el usuario no funcionarán en este escenario, ya que requieren que el usuario seleccione al menos un nivel de cada factor, incluidos aquellos que no están en la interacción de interés. Si estoy investigando la interacción especie x período de tiempo, los valores deben promediarse en todos los niveles de color e irrigación. En esencia, quiero probar cortes, pero no parece ser una opción en la salida del modelo mixto, y no puedo analizar estos datos en la personalidad de mínimos cuadrados estándar porque estoy utilizando la estructura AR(1) para las medidas repetidas. ¿Tiene alguna sugerencia para analizar los efectos simples en este escenario?
Antes de profundizar demasiado en el análisis que incluye la estructura, ¿tiene una base racional, además del valor AICc, para aceptar la estructura AR(1)? En otras palabras, ¿la sugerencia de autorregresión en los datos (con un rezago de una fila) le hace decir algo como "Sí, eso tiene sentido debido a xyz"?
El video en este enlace puede ser útil, comenzando alrededor del minuto 25-26.
