コンピュータ支援生物学および合理的に設計された実験の自動化(2019-EU-EPO-080)レベル: 初心者
職務: アナリスト/科学者/エンジニア
スティーブン・ブラウン、バイオプロセス科学者、Synthace
マイケル・サドウスキー、Synthace社バイオインフォマティクス部門責任者
生物学は複雑です。この複雑さを受け入れ、特に治療薬の開発においては、動的かつ多因子的な「生物学的パラメータランドスケープ」を反復的に理解することに重点を置いた作業方法を採用する必要があります。バイオ医薬品企業は現在、高度な細胞療法へと移行しており、多くの場合、患者ごとに製造され、多様なドナー材料から臨床的に有効な製品を製造する必要があります。このような高度な細胞療法には、大きなメリットとリスクが伴います。Synthaceでは、コンピュータ支援生物学(Computer Aided Biology)を概念的枠組みとして、そしてデジタルから物理への研究ツールの新たなエコシステムとして導入しました。これにより、生物学研究者は、より高スループットで、還元主義的ではなく、反復的な方法で、ますます複雑化する実験に取り組むことができます。Synthaceの研究者は、JMP DOEプラットフォームを用いて、実験を合理的に設計・評価しています。実験計画は、独自のソフトウェア(Antha)によって、デバイスに依存しない低レベルの液体処理指示へと解釈され、チーム間で容易に再現・共有できるプロトコルが作成されます。さらに、Anthaは、転送すべき共通性を特定することでプロトコルを最適化し、転送順序などの制約を指定することもできます。これらのツールを組み合わせることで、実験における因子空間を拡大し、動的かつ多因子的な「生物学的パラメータランドスケープ」に関する知識を得ることができます。